Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.215860 Ascc3l1activating signal cointegrator 1 complex subunit 3-like 1 2  2 62.2 cM  320632 
 Gene Ontology ATP binding | ATP dependent helicase activity | helicase activity | hydrolase activity
 Human Homolog ASCC3L1[activating signal cointegrator 1 complex subunit 3-like 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 142 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAACTTGAAA (2)
AACTGTACAA
ATTTTTTTTT (4)
CATTTGCTAG
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
TGGTCTAGGA
63.40.0634
Cb medulloblastomaAACTGTACAA
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
55.40.0554
P8 GC+1d cultureAACTGTACAA
ATTTTTTTTT (4)
CATTTGCTAG
CTACTCTTCT (2)
GCCAAAAAAA (4)
GGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
TCTTTGAATG (2)
TGCCTGCTTT
62.60.0626
P8 GC+SHH+1d cultureATTTTTTTTT (4)
CATTTGCTAG
GCCAAAAAAA (4)
GGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCAACTTCAG
TCTCTGAATG (2)
TCTTTGAATG (2)
690.069
3T3 fibroblastsGGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
350.035
E15 cortexCTGGAAAAAA
GAGATCAGCT (3)
GCCAAAAAAA (4)
GGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
74.10.0741
P1 cortexATTTTTTTTT (4)
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
40.90.0409
HypothalamusGAGATCAGCT (3)
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
56.10.0561
E12.5 retinaAAACTTGAAA (2)
CATTTGCTAG
CTGGAAAAAA
GGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
101.50.1015
E14.5 retinaAACTGTACAA
ATTTTTTTTT (4)
CATTTGCTAG
CTACTCTTCT (2)
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCAACTTCAG
TCTCTGAATG (2)
TGGGGGATTC (2)
89.20.0892
E16.5 retinaCATTTGCTAG
CTACTCTTCT (2)
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCAACTTCAG
TCTCTGAATG (2)
670.067
E18.5 retinaAACTGTACAA
ATTTTTTTTT (4)
CATTTGCTAG
CTGGAAAAAA
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
TGGGGGATTC (2)
98.10.0981
P0.5 retinaATTTTTTTTT (4)
CTGGAAAAAA
GCCAAAAAAA (4)
GGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
66.80.0668
P2.5 retinaATTTTTTTTT (4)
CATTTGCTAG
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
TCTTTGAATG (2)
100.40.1004
P4.5 retinaATTTTTTTTT (4)
CATTTGCTAG
CTGGAAAAAA
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
TCTTTGAATG (2)
TGCCTGCTTT
115.10.1151
P6.5 retinaCATTTGCTAG
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
TGCCTGCTTT
TTGAAAAACA
81.80.0818
P10.5 crx- retinaGAGATCAGCT (3)
GCCAAAAAAA (4)
GGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
TGCCTGCTTT
TGGTCTAGGA
81.90.0819
P10.5 crx+ retinaAACTGTACAA
CATTTGCTAG
GCCAAAAAAA (4)
GGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
105.60.1056
Adult retinalCATTTGCTAG
GCCAAAAAAA (4)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
1130.113
ONLAAACTTGAAA (2)
CTGGAAAAAA
GCCAAAAAAA (4)
GGGAGCTCCA (2)
GTGGCTCATA (2)
GTTTTCTAGT (2)
TCTCTGAATG (2)
TGCCTGCTTT
TGGTCTAGGA
TTGAAAAACA
1340.134