Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.216227 Csnk1dcasein kinase 1, delta 11    104318 
 Mm.216227 D930010H05RikRIKEN cDNA D930010H05 gene 11    320154 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 140 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGGGCTGGGGA
GGGGTGGGAA
GGTTTCAACT (2)
GTGATGGAAG
TACATACATA (2)
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
TTTGTGCCAC (4)
99.40.0994
Cb medulloblastomaGGGCTGGGAA (3)
GGGGTGGGAA
GGTTTCAACT (2)
GTGATGGAAG
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
143.30.1433
P8 GC+1d cultureCACTGGGCTG
GCTTCTCCCT (4)
GGGCTGGGAC (2)
GGTTTCAACT (2)
GTGATGGAAG
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTAGTGTTCT
TTTGCAGAGA (2)
88.80.0888
P8 GC+SHH+1d cultureGCTTCTCCCT (4)
GGTTTCAACT (2)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
120.60.1206
3T3 fibroblastsGCTTCTCCCT (4)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
227.80.2278
E15 cortexGGTTTCAACT (2)
TGGTTGCTGG
2820.282
P1 cortexGCTTCTCCCT (4)
GGCTTCTCCC (2)
GGGCTGGGAA (3)
GGGCTGGGGA
GGGGTGGGAA
GGTTTCAACT (2)
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
131.50.1315
HypothalamusCACTGGGCTG
GCTTCTCCCT (4)
GGATGGGACA
GGGCTGGGGA
GGTTTCAACT (2)
TACATACATA (2)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
380.30.3803
E12.5 retinaCACTGGGCTG
GCTTCTCCCT (4)
GGTTTCAACT (2)
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
189.70.1897
E14.5 retinaGCCCAGGAAG (2)
GCTTCTCCTT (2)
GGGCTGGGGA
GGTTTCAACT (2)
GTGATGGAAG
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
978.30.9783
E16.5 retinaCACTGGGCTG
GCCCAGGAAG (2)
GCTTCTCCCT (4)
GCTTCTCCTT (2)
GGGCTGGGAC (2)
GGGCTGGGGA
GGTTTCAACT (2)
TACATACATA (2)
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
811.20.8112
E18.5 retinaCACTGGGCTG
GCTTCTCCCT (4)
GGATGGGACA
GGGCTGGGAC (2)
GGGCTGGGGA
GGGGTGGGAA
GGTTTCAACT (2)
TACATACATA (2)
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
305.50.3055
P0.5 retinaGCTTCTCCTT (2)
GGCTTCTCCC (2)
GGGCTGGGAC (2)
GGGGTGGGAA
GGTTTCAACT (2)
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
214.20.2142
P2.5 retinaGCTTCTCCCT (4)
GGCTTCTCCC (2)
GGGCTGGGGA
GGTTTCAACT (2)
GTGATGGAAG
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
207.80.2078
P4.5 retinaCACTGGGCTG
GCTTCTCCCT (4)
GGGCTGGGAC (2)
GGTTTCAACT (2)
GTGATGGAAG
TACATACATA (2)
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
190.30.1903
P6.5 retinaCACTGGGCTG
GCTTCTCCCT (4)
GGTTTCAACT (2)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
TTTTTCTGTA (2)
175.10.1751
P10.5 crx- retinaGGTTTCAACT (2)
TACATACATA (2)
TGGTTGCTGG
297.20.2972
P10.5 crx+ retinaGGTTTCAACT (2)
TGGTTGCTGG
TTAGTGTTCT
TTTGCAGAGA (2)
TTTTTCTGTA (2)
117.20.1172
Adult retinalCACTGGGCTG
GCTTCTCCCT (4)
GGTTTCAACT (2)
TACATACATA (2)
TATATATGTA (5)
TGGTTGCTGG
TTTGCAGAGA (2)
235.40.2354
ONLCACTGGGCTG
GGGCTGGGGA
GGTTTCAACT (2)
GTGATGGAAG
TACATACATA (2)
TGGTTGCTGG
TTAGTGTTCT
TTTGCAGAGA (2)
TTTGTGCCAC (4)
444.30.4443