Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.21758	Cyp2e1	cytochrome P450, family 2, subfamily e, polypeptide 1	7	7 68.4 cM	13106
Gene Ontology	electron transport | endoplasmic reticulum | extracellular space | membrane | microsome | monooxygenase activity | oxidoreductase activity | oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen
Human Homolog	CYP2E1[cytochrome P450, family 2, subfamily E, polypeptide 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 254 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAATTGTGT (7) AAAGAAAAAA (2) AAGTTTGGTT (2) GAAAAATATT (3) GAAAGGAAAA GCCCGGGAGT GCGGCTCACA (2) GGGACAACCA GTGGTAACAA (2) GTGTCTCACA TAAAAATGTT (5) TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) TTGTCTGAAA 73.2 0.0732 Cb medulloblastoma AAAAATGTGG (2) AAACGCAAAA AAAGAAAAAA (2) GCCCGGGAGT GCGGCTCACA (2) GGGAGAAAAA (6) GTGCTCACAA (4) GTGTCTCACA TTGGCTCACA (5) 55.3 0.0553 P8 GC+1d culture AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAATTGTGT (7) AAACGCAAAA AAAGAAAAAA (2) GAAAAATATT (3) GCCCGGGAGT GCGGCTCACA (2) GGGACAACCA GGGAGAAAAA (6) GGTGGCTCAC GTGTCTCACA TAAAAATGTT (5) TACACACAAG TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 58.2 0.0582 P8 GC+SHH+1d culture AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAATTGTGT (7) AAACGCAAAA AAAGAAAAAA (2) GAAAAATATT (3) GCCCGGGAGT GCGGCTCACA (2) GGGACAACCA GGGAGAAAAA (6) GGTGGCTCAC GTGCTCACAA (4) GTGTCTCACA TAAAAATGTT (5) TACACACAAG TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) TTGTCTGAAA 73.8 0.0738 3T3 fibroblasts AACACAATGT GCGGCTCACA (2) GTGTCTCACA TTGGCTCACA (5) 42 0.042 E15 cortex AAAAATGTGG (2) AAAATTGTGT (7) AAAGAAAAAA (2) GCGGCTCACA (2) GTGTCTCACA TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 118.5 0.1185 P1 cortex AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAATTGTGT (7) AAAGAAAAAA (2) GAAAAATATT (3) GCGGCTCACA (2) GGTGGCTCAC GTGTCTCACA TACACACAAG 90.7 0.0907 Hypothalamus AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAATTGTGT (7) AAACGCAAAA AAAGAAAAAA (2) AAGTTTGGTT (2) GAAAAATATT (3) GCGGCTCACA (2) GGTGGCTCAC GTGCTCACAA (4) GTGTCTCACA TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) TTGTCTGAAA 75.9 0.0759 E12.5 retina AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAATTGTGT (7) AAACGCAAAA GAAAAATATT (3) GAAACCTTAC GAGTTTGTTC GCGGCTCACA (2) GGGAGAAAAA (6) GGTGGCTCAC GTGGTAACAA (2) TAAAAATGTT (5) TACACACAAG TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 103.5 0.1035 E14.5 retina AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AACACAATGT GAAAAATATT (3) GAAAGGAAAA GCCCGGGAGT GCGGCTCACA (2) GGGAGAAAAA (6) GTGCTCACAA (4) GTGTCTCACA TACACACTTT TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 90.9 0.0909 E16.5 retina AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAATTGTGT (7) AAACGCAAAA AAAGAAAAAA (2) AGTGTGTACA (3) GAAAAATATT (3) GAAACCTTAC GAGTTTGTTC GCGGCTCACA (2) GGGAGAAAAA (6) GGTGGCTCAC GTGCTCACAA (4) GTGGTAACAA (2) GTGGTCACAA GTGTCTCACA TACACACAAG TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 115.6 0.1156 E18.5 retina AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAACTGTGT (3) AAACGCAAAA AAAGAAAAAA (2) AGTGTGTACA (3) GAAAAATATT (3) GAAAGGAAAA GCGGCTCACA (2) GGTGGCTCAC GTGGTAACAA (2) GTGTCTCACA TAAAAATGTT (5) TTGGCTCACA (5) 99.9 0.0999 P0.5 retina AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAGAAAAAA (2) AGTGTGTACA (3) GAAAAATATT (3) GAGTTTGTTC GCGGCTCACA (2) GGTGGCTCAC GTGCTCACAA (4) GTGGTAACAA (2) GTGGTCACAA GTGTCTCACA TACACACAAG TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 80.8 0.0808 P2.5 retina AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAACTGTGT (3) AAAGAAAAAA (2) AAGTTTGGTT (2) AGACCTTGTG GAAAAATATT (3) GAGTTTGTTC GCGGCTCACA (2) GGGACAACCA GGTGGCTCAC GTGTCTCACA TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 75.8 0.0758 P4.5 retina AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAAACTGTGT (3) AAAGAAAAAA (2) AACACAATGT AGTGTGTACA (3) GAAAAATATT (3) GCGGCTCACA (2) GGTGGCTCAC GTGTCTCACA TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 81.3 0.0813 P6.5 retina AAAAATGTGG (2) AAAAATGTTG (2) AAACGCAAAA AAAGAAAAAA (2) AACACAATGT AGTGTGTACA (3) GAAAAATATT (3) GCGGCTCACA (2) GGTGGCTCAC GTGTCTCACA TAAAAATGTT (5) TACACACTTT TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) TTGTCTGAAA 81.8 0.0818 P10.5 crx- retina AAAAATGTGG (2) AAAATTGTGT (7) AACACAATGT GAAAAATATT (3) GCGGCTCACA (2) GGTGGCTCAC GTGGTCACAA GTGTCTCACA TAAAAATGTT (5) TTGGCTCACA (5) 52.2 0.0522 P10.5 crx+ retina AAAAATGTGG (2) AAACGCAAAA AACACAATGT GAAAAATATT (3) GAAACCTTAC GAGGTTTGTT GCGGCTCACA (2) GGGACAACCA GGTGGCTCAC GTGCTCACAA (4) GTGTCTCACA TTGGCTCACA (5) 69.1 0.0691 Adult retinal AAAAATGTGG (2) GAAAGGAAAA GCGGCTCACA (2) GGGACAACCA GGTGGCTCAC GTGCTCACAA (4) GTGGTCACAA GTGTCTCACA TGTCTTGAAT (2) TTGGCTCACA (5) 55.8 0.0558 ONL AAAAATGTGG (2) AAAGAAAAAA (2) AGACCTTGTG GAAAAATATT (3) GCGGCTCACA (2) GGGAGAAAAA (6) GGTGGCTCAC GTGCTCACAA (4) GTGTCTCACA TACACACAAG TTGGCTCACA (5) TTGTCTGAAA 89.8 0.0898