Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.22109 2610204L23RikRIKEN cDNA 2610204L23 gene 11  11 E1  67163 
 Mm.22109 D13Mgi22DNA Segment, Chr 13, Mouse Genome Informatics 22 13    97906 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 14 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 87 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAATTTCTAG (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
GGAGAAGTCA (2)
TACACAGTAG (5)
TTTTTTAACA (2)
12.90.0129
Cb medulloblastomaGCTTTGTGTA (4)
TTTTTTAACA (2)
4.60.0046
P8 GC+1d cultureATACAATCTG (2)
CAGGTGATAC (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
GGAAGAAGAC (2)
TACACAGTAG (5)
TTTTTTAACA (2)
13.60.0136
P8 GC+SHH+1d cultureAAAGGGCTCT
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TAGAGCTGGT (2)
TGAAAAATCC
TTTTTTAACA (2)
11.80.0118
3T3 fibroblastsAAAGGGCTCT
GCTTTGTGTA (4)
70.007
E15 cortexGAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
14.80.0148
P1 cortexGCTTTGTGTA (4)
4.50.0045
HypothalamusAAATTTCTAG (2)
ATACAATCTG (2)
TACACAGTAG (5)
TAGAGCTGGT (2)
90.009
E12.5 retinaAAAGGGCTCT
AAATTTCTAG (2)
GAGGAGCTGA (3)
TTTTTTAACA (2)
9.50.0095
E14.5 retinaGAAGATTCTG (2)
GCTTTGTGTA (4)
GGAAGAAGAC (2)
GGAGAAGTCA (2)
TACACAGTAG (5)
TAGAGCTGGT (2)
14.40.0144
E16.5 retinaTACACAGTAG (5)
1.80.0018
E18.5 retinaAAATTTCTAG (2)
ATACAATCTG (2)
GAGGAGCTGA (3)
TTTTTTAACA (2)
7.20.0072
P0.5 retinaGCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TAGAGCTGGT (2)
TTTTTTAACA (2)
11.80.0118
P2.5 retinaAGGCGGAAGC
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TAGAGCTGGT (2)
TTTTTTAACA (2)
14.20.0142
P4.5 retinaAGGCGGAACG (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TTTTTTAACA (2)
13.90.0139
P6.5 retinaAGGCGGAACG (2)
GCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TGAAAAATCC
TTTTTTAACA (2)
13.30.0133
P10.5 crx- retinaAAATTTCTAG (2)
AGGCGGAACG (2)
CAGGTGATAC (2)
GAAGATTCTG (2)
GCTTTGTGTA (4)
TAGAGCTGGT (2)
26.20.0262
P10.5 crx+ retinaAAATTTCTAG (2)
AGGCGGAACG (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TTTTTTAACA (2)
30.70.0307
Adult retinalAGGCGGAACG (2)
GAGGAGCTGA (3)
TACACAGTAG (5)
TGAAAAATCC
TTTTTTAACA (2)
16.90.0169
ONLAGGCGGAACG (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
GGAGAAGTCA (2)
TGAAAAATCC
TTTTTTAACA (2)
13.30.0133