Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.22501 5730590C14RikRIKEN cDNA 5730590C14 gene 11    77097 
 Mm.22501 3526402J09RikRIKEN cDNA 3526402J09 gene 11    237960 
 Gene Ontology DNA binding | regulation of transcription, DNA-dependent | transcription factor activity
 Human Homolog DKFZP564D166[putative ankyrin-repeat containing protein]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 77 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGCAAAGCAAA
GTGACTCACA (2)
TACAGTCTAC (3)
TTTTATAAGA (2)
27.80.0278
Cb medulloblastomaGCAAAGCAAA
GCCTCCTTCC (2)
GTGACTCACA (2)
TACAGTCTAC (3)
TTTTATAAAA
36.90.0369
P8 GC+1d cultureCAATGCCTTG (2)
GCAAAGCAAA
GTGACTCACA (2)
TACAGAAAAT (2)
TATACAGAGC (2)
TTTTATAAAA
TTTTATAAGA (2)
27.30.0273
P8 GC+SHH+1d cultureGCAAAGCAAA
GTGACTCACA (2)
TACAGTCTAC (3)
TTTTATAAAA
TTTTATAAGA (2)
340.034
3T3 fibroblastsGTCTTCTCCC (2)
GTGACTCACA (2)
38.50.0385
E15 cortexGTGACTCACA (2)
19.80.0198
P1 cortexGTGACTCACA (2)
TATACAGAGC (2)
TTTTATAAAA
36.30.0363
HypothalamusGCAAAGCAAA
GTGACTCACA (2)
TACAGAAAAT (2)
TACAGTCTAC (3)
TATACAGAGC (2)
32.50.0325
E12.5 retinaGTGACTCACA (2)
TACAGTCTAC (3)
TTTTATAAAA
39.50.0395
E14.5 retinaGTCTTCTCCC (2)
GTGACTCACA (2)
TTTTATAAAA
49.10.0491
E16.5 retinaGCAAAGCAAA
GTGACTCACA (2)
TTTTATAAAA
34.40.0344
E18.5 retinaCAATGCCTTG (2)
GCAAAGCAAA
GTGACTCACA (2)
TATACAGAGC (2)
TTTTATAAAA
43.60.0436
P0.5 retinaGCCTCCTTCC (2)
GTGACTCACA (2)
TATACAGAGC (2)
TTTTATAAAA
37.30.0373
P2.5 retinaGTGACTCACA (2)
TACAGTCTAC (3)
TTTTATAAAA
40.40.0404
P4.5 retinaGCAAAGCAAA
GCCTCCTTCC (2)
GTGACTCACA (2)
TATACAGAGC (2)
TTTTATAAAA
41.60.0416
P6.5 retinaGCAAAGCAAA
GTGACTCACA (2)
TACAGTCTAC (3)
TATACAGAGC (2)
TTTTATAAAA
40.10.0401
P10.5 crx- retinaCAATGCCTTG (2)
GTCTTCTCCC (2)
GTGACTCACA (2)
TACAGTCTAC (3)
TTTTATAAAA
37.30.0373
P10.5 crx+ retinaGTGACTCACA (2)
TACAGAAAAT (2)
TACAGTCTAC (3)
TATACAGAGC (2)
36.50.0365
Adult retinalGCAAAGCAAA
GTGACTCACA (2)
35.20.0352
ONLGTGACTCACA (2)
TATACAGAGC (2)
TTTTATAAAA
42.10.0421