Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.227176 AI647874expressed sequence AI647874 17    106629 
 Mm.227176 Slc3a1solute carrier family 3, member 1 17  17 51.0 cM  20532 
 Mm.227176 D030028O16RikRIKEN cDNA D030028O16 gene 17    213760 
 Human Homolog KIAA0436[putative prolyl oligopeptidase]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 95 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATGGCATCA (4)
CCACAGAGCT (6)
CTGCACCAAT
CTGGCTTCTT (2)
GAGTAGACTC (4)
GTGGTGGTTT (3)
35.90.0359
Cb medulloblastomaAATATTTCAA
AATGGCATCA (4)
ATCACCAAAA
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CCTGAAGGAA
CTGCACCAAT
GAGTAGACTC (4)
32.20.0322
P8 GC+1d cultureAATATTTCAA
ATCACCAAAA
CCACAGAGCT (6)
CTGCACCAAT
CTGGCTTCTT (2)
53.60.0536
P8 GC+SHH+1d cultureAATATTTCAA
AATGGCATCA (4)
AGCGAACATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CTGCACCAAT
CTGGCTTCTT (2)
36.40.0364
3T3 fibroblastsAATGGCATCA (4)
CCACAGAGCT (6)
CTGGCTTCTT (2)
GTGGTGGTTT (3)
38.50.0385
E15 cortexAGCGAACATT (3)
CCACAGAGCT (6)
44.50.0445
P1 cortexCATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CCTGAAGGAA
CTGCACCAAT
CTGGCTTCTT (2)
72.70.0727
HypothalamusAATATTTCAA
AGCGAACATT (3)
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
GAGTAGACTC (4)
TTAACTGAAG (7)
30.70.0307
E12.5 retinaCCACAGAGCT (6)
CTGGCTTCTT (2)
18.80.0188
E14.5 retinaAATGGCATCA (4)
ATCACCAAAA
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CTGGCTTCTT (2)
TGTCATCTAA (3)
400.04
E16.5 retinaAATATTTCAA
CCACAGAGCT (6)
GAGTAGACTC (4)
TTAACTGAAG (7)
56.10.0561
E18.5 retinaCATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CTGGCTTCTT (2)
30.90.0309
P0.5 retinaCATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CTGGCTTCTT (2)
GAGTAGACTC (4)
TGTCATCTAA (3)
51.10.0511
P2.5 retinaCATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CTGGCTTCTT (2)
33.40.0334
P4.5 retinaAATATTTCAA
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CTGGCTTCTT (2)
GTGGTGGTTT (3)
35.80.0358
P6.5 retinaAATATTTCAA
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CTGGCTTCTT (2)
TGAACTGAAG (3)
43.30.0433
P10.5 crx- retinaAATATTTCAA
AGCGAACATT (3)
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
GAGTAGACTC (4)
GTGGTGGTTT (3)
78.20.0782
P10.5 crx+ retinaATCACCAAAA
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
230.023
Adult retinalAATATTTCAA
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
CTGCACCAAT
CTGGCTTCTT (2)
33.40.0334
ONLAATATTTCAA
AATGGCATCA (4)
CATAAAGATT (3)
CCACAGAGCT (6)
TGTCATCTAA (3)
TTAACTGAAG (7)
210.021