| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CTTGCTCTGT (2) TCAGAGGCAG
| 3.2 | 0.0032 |
| Cb medulloblastoma | GAGCGGGTCA (3)
| 4.6 | 0.0046 |
| P8 GC+1d culture | AGGTCCTGGA (3) CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3) TCAGAGGCAG
| 19.3 | 0.0193 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AGGTCCTGGA (3) CCTCCTGGAT CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3) TCAGAGGCAG
| 11.8 | 0.0118 |
| 3T3 fibroblasts | AGGTCCTGGA (3) CCTCCTGGAT CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3) TCAGAGGCAG
| 52.6 | 0.0526 |
| E15 cortex | CCTCCTGGAT CTTGCTCTGT (2) GCTGTGGCAA
| 14.7 | 0.0147 |
| P1 cortex | CCTCCTGGAT
| 4.5 | 0.0045 |
| Hypothalamus | AGGTCCTGGA (3) GAGCGGGTCA (3) GCTGTGGCAA
| 9 | 0.009 |
| E12.5 retina | CCTCCTGGAT CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3)
| 13.2 | 0.0132 |
| E14.5 retina | CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3) TCAGAGGCAG
| 12.7 | 0.0127 |
| E16.5 retina | CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3)
| 10.8 | 0.0108 |
| E18.5 retina | CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3)
| 11 | 0.011 |
| P0.5 retina | AGGTCCTGGA (3) TCAGAGGCAG
| 7.9 | 0.0079 |
| P2.5 retina | CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3) GCTGTGGCAA
| 7.1 | 0.0071 |
| P4.5 retina | CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3)
| 9.9 | 0.0099 |
| P6.5 retina | CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3)
| 6.7 | 0.0067 |
| P10.5 crx- retina | CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3)
| 3.8 | 0.0038 |
| P10.5 crx+ retina | CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3)
| 9.6 | 0.0096 |
| Adult retinal | AGGTCCTGGA (3) CTTGCTCTGT (2) GAGCGGGTCA (3)
| 7.5 | 0.0075 |
| ONL | GCTGTGGCAA
| 1.9 | 0.0019 |