Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.235960 5730416O20RikRIKEN cDNA 5730416O20 gene 10    70557 
 Mm.235960 2900006A17RikRIKEN cDNA 2900006A17 gene 10    72913 
 Mm.235960 2900054D09RikRIKEN cDNA 2900054D09 gene 10    73013 
 Mm.235960 4833431D13RikRIKEN cDNA 4833431D13 gene 10    268307 
 Mm.235960 9430064K01RikRIKEN cDNA 9430064K01 gene 10    77294 
 Mm.235960 Ank3ankyrin 3, epithelial 10  10 38.0 cM  11735 
 Gene Ontology cytoskeleton | synapse
 Human Homolog ANK3[ankyrin 3, node of Ranvier (ankyrin G)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 136 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGATGAAGACT (2)
GGAGATTTTA (6)
GTGGAAGGAG
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TTAACAAAAT
TTATTAAAAA (6)
TTCTTCAGAC (6)
TTGCTGCCTT
48.90.0489
Cb medulloblastomaGATGAAGACT (2)
GCATCTGTAA (2)
GGAGATTTTA (6)
TATGAGAAAA (6)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureATGACCAGTA (7)
CCGCCTCCCA (6)
GATGAAGACT (2)
GGAGATTTTA (6)
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TCATTTAGAG (6)
TTATTAAAAA (6)
TTCTTCAGAC (6)
TTGCTGCCTT
59.30.0593
P8 GC+SHH+1d cultureATGACCAGTA (7)
GATGAAGACT (2)
GCAACTCACA
GCATCTGTAA (2)
GGAGATTTTA (6)
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TCATTTAGAG (6)
TGGCTGCCCA (2)
TTATTAAAAA (6)
TTCTTCAGAC (6)
TTGCTGCCTT
49.30.0493
3T3 fibroblastsGATGAAGACT (2)
TTCTTCAGAC (6)
TTGCTGCCTT
210.021
E15 cortexGATGAAGACT (2)
GGAGATTTTA (6)
TTGCTGCCTT
44.50.0445
P1 cortexGATGAAGACT (2)
GGAGATTTTA (6)
GTGGAAGGAG
GTTAATAAAC (6)
TGGCTGCCCA (2)
TTCTTCAGAC (6)
TTGCTGCCTT
40.60.0406
HypothalamusGCATCTGTAA (2)
GGAGATTTTA (6)
GTGGAAGGAG
GTGGGATGCT (6)
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TTGCTGCCTT
19.80.0198
E12.5 retinaATGACCAGTA (7)
GATGAAGACT (2)
GCAACTCACA
GTGGGATGCT (6)
TATGAGAAAA (6)
TGGCTGCCCA (2)
TTGCTGCCTT
43.40.0434
E14.5 retinaATGTCTGTGT (3)
CCGCCTCCCA (6)
GAAAATGAAA
GATGAAGACT (2)
GCATCTGTAA (2)
GGAGATTTTA (6)
GTGGAAGGAG
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TTATTAAAAA (6)
TTGCTGCCTT
490.049
E16.5 retinaATGTCTGTGT (3)
ATTACGCCAA
CCGCCTCCCA (6)
GATGAAGACT (2)
GCAACTCACA
GTGGAAGGAG
GTGGGATGCT (6)
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TCATTTAGAG (6)
TTATTAAAAA (6)
TTGCTGCCTT
470.047
E18.5 retinaGATGAAGACT (2)
GCATCTGTAA (2)
GTGGGATGCT (6)
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TTCTTCAGAC (6)
TTGCTGCCTT
32.70.0327
P0.5 retinaATTACGCCAA
CCTTTATCTT (6)
GATGAAGACT (2)
TATGAGAAAA (6)
TTGCTGCCTT
27.60.0276
P2.5 retinaATGACCAGTA (7)
GATGAAGACT (2)
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TTCTTCAGAC (6)
TTGCTGCCTT
45.80.0458
P4.5 retinaGAAAATGAAA
GATGAAGACT (2)
GTTAATAAAC (6)
TATGAGAAAA (6)
TTAACAAAAT
TTATTAAAAA (6)
TTGCTGCCTT
45.60.0456
P6.5 retinaGAAAATGAAA
GATGAAGACT (2)
TATGAGAAAA (6)
TTATTAAAAA (6)
TTCTTCAGAC (6)
TTGCTGCCTT
31.70.0317
P10.5 crx- retinaGATGAAGACT (2)
TATGAGAAAA (6)
TTATTAAAAA (6)
TTGCTGCCTT
18.60.0186
P10.5 crx+ retinaGATGAAGACT (2)
GCAACTCACA
TATGAGAAAA (6)
TTGCTGCCTT
24.90.0249
Adult retinalATTACGCCAA
GATGAAGACT (2)
GCAACTCACA
GTGGAAGGAG
TTGCTGCCTT
31.60.0316
ONLCCTTTATCTT (6)
GATGAAGACT (2)
GCAACTCACA
GTGGAAGGAG
TATGAGAAAA (6)
TTATTAAAAA (6)
TTGCTGCCTT
26.80.0268