Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.237594	Ufd1l	ubiquitin fusion degradation 1 like	16	16 11.75 cM	22230
Mm.237594	D630030B22Rik	RIKEN cDNA D630030B22 gene	16		53963
Mm.237594	9430099O15Rik	RIKEN cDNA 9430099O15 gene	16		53965
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 74 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACGAGGAAT CTGATCCAGC (3) GAATAAAGTG (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) 60.3 0.0603 Cb medulloblastoma AACGAGGAAT CTGATCCAGC (3) GCTCAAAAAA (4) GGGCTGGGAA (3) GTGGCTCAAA (2) 224.2 0.2242 P8 GC+1d culture CTGATCCAGC (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) 21.7 0.0217 P8 GC+SHH+1d culture CTGATCCAGC (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) 17.5 0.0175 3T3 fibroblasts CTGATCCAGC (3) GAATAAAGTG (3) GTGGCTCAAA (2) 17.5 0.0175 E15 cortex AACGAGGAAT CTGATCCAGC (3) GTGGCTCAAA (2) 39.5 0.0395 P1 cortex CTGATCCAGC (3) GAATAAAGTG (3) GGGCTGGGAA (3) GTGGCTCAAA (2) 31.7 0.0317 Hypothalamus CTGATCCAGC (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) TATTTCTAGA (3) 14.4 0.0144 E12.5 retina CTGATCCAGC (3) GTGGCTCAAA (2) TGTGAAGTCC 18.8 0.0188 E14.5 retina CTGATCCAGC (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) 32.7 0.0327 E16.5 retina CTGATCCAGC (3) GAATAAAGTG (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) TATTTCTAGA (3) TGTGAAGTCC 27.2 0.0272 E18.5 retina AACGAGGAAT CTGATCCAGC (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) 25.5 0.0255 P0.5 retina CTGATCCAGC (3) GAATAAAGTG (3) GTGGCTCAAA (2) 27.6 0.0276 P2.5 retina CTGATCCAGC (3) GAATAAAGTG (3) GTGGCTCAAA (2) 23 0.023 P4.5 retina AACGAGGAAT CTGATCCAGC (3) GTGGCTCAAA (2) 17.8 0.0178 P6.5 retina CTGATCCAGC (3) GAATAAAGTG (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) 30.1 0.0301 P10.5 crx- retina AACGAGGAAT CTGATCCAGC (3) GTGGCTCAAA (2) 13 0.013 P10.5 crx+ retina AACGAGGAAT CTGATCCAGC (3) GTGGCTCAAA (2) TGTGAAGTCC 38.5 0.0385 Adult retinal CTGATCCAGC (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) 20.5 0.0205 ONL AACGAGGAAT CTGATCCAGC (3) GCTCAAAAAA (4) GTGGCTCAAA (2) TATTTCTAGA (3) 17.1 0.0171