Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.246240	Zranb1	zinc finger, RAN-binding domain containing 1	7	7 65.6 cM	360216
Mm.246240	1500002F19Rik	RIKEN cDNA 1500002F19 gene	7		76683
Mm.246240	2510016G02Rik	RIKEN cDNA 2510016G02 gene	7		72438
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 13 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 193 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GGCACTCATA (3) TATCATCTTT (2) TGCACTTCCT TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 275.5 0.2755 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGAAAAGCT (4) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GAGCGAGCCA (3) GCCGCCTGGG (3) GGCACTCATA (3) TATCATCTTT (2) TTGGTTAGTT TTGTGGTGAC (2) 1024.3 1.0243 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) AATTTTTTTT (2) AGGAGATGGA (3) CAGAAAAGCT (4) CAGACAGTCT (4) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCCGCCTGGG (3) GCTGGGTGGC (3) TAACTAGCTG (3) TAGTGTCCTG (3) TATCATCTTT (2) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 286.3 0.2863 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) AATTTTTTTT (2) AGGAGATGGA (3) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCCGCCTGGG (3) GGCACTCATA (3) TAACTAGCTG (3) TATCATCTTT (2) TGCACTTCCT TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 383.1 0.3831 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) GCCGCCTGGG (3) 38.5 0.0385 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) AATTTTTTTT (2) AGGAGATGGA (3) CAGACAGTCT (4) GAAAAAAAAA (2) GAGATCAGCT (3) GCTGGGTGGC (3) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 311.5 0.3115 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) GAAAAAAAAA (2) GCCGCCTGGG (3) GGCACTCATA (3) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 308.9 0.3089 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGAAAAGCT (4) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GAGATCAGCT (3) TGCACTTCCT TTGTGGTGAC (2) 211.8 0.2118 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) TAACTAGCTG (3) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 206.6 0.2066 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGACAGTCT (4) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCTGGGTGGC (3) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 165.7 0.1657 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGACAGTCT (4) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GAGCGAGCCA (3) GCTGGGTGGC (3) TAACTAGCTG (3) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 121.2 0.1212 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCTGGGTGGC (3) TAACTAGCTG (3) TTCTATTCAT (6) TTGGTTAGTT TTGTGGTGAC (2) 476.5 0.4765 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGACAGTCT (4) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) TAACTAGCTG (3) TAGTGTCCTG (3) TTGGTTAGTT TTGTGGTGAC (2) 186.6 0.1866 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCTGGGTGGC (3) GGCACTCATA (3) TAGTGTCCTG (3) TATCATCTTT (2) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 477 0.477 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCCGCCTGGG (3) GCTGGGTGGC (3) GGCACTCATA (3) TAACTAGCTG (3) TATCATCTTT (2) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 433.9 0.4339 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCTGGGTGGC (3) GGCACTCATA (3) TAACTAGCTG (3) TATCATCTTT (2) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 395.2 0.3952 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GAGATCAGCT (3) GCCGCCTGGG (3) GCTGGGTGGC (3) GGCACTCATA (3) TAACTAGCTG (3) TAGTGTCCTG (3) TATCATCTTT (2) TGCACTTCCT TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 158.2 0.1582 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGACAGTCT (4) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCCGCCTGGG (3) GGCACTCATA (3) TAACTAGCTG (3) TAGTGTCCTG (3) TATCATCTTT (2) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 230.6 0.2306 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGAAAAGCT (4) CAGACAGTCT (4) CAGCATAAAT GAAAAAAAAA (2) GCCGCCTGGG (3) GCTGGGTGGC (3) TAACTAGCTG (3) TATCATCTTT (2) TTCTATTCAT (6) TTGTGGTGAC (2) 107.7 0.1077 ONL AAAAAAAAAA (2) AGGAGATGGA (3) CAGAAAAGCT (4) GAAAAAAAAA (2) GAGCGAGCCA (3) GCCGCCTGGG (3) GGCACTCATA (3) TAACTAGCTG (3) TTGTGGTGAC (2) 147.3 0.1473