Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.246240 Zranb1zinc finger, RAN-binding domain containing 1 7  7 65.6 cM  360216 
 Mm.246240 1500002F19RikRIKEN cDNA 1500002F19 gene 7    76683 
 Mm.246240 2510016G02RikRIKEN cDNA 2510016G02 gene 7    72438 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 13 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 193 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GGCACTCATA (3)
TATCATCTTT (2)
TGCACTTCCT
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
275.50.2755
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGAAAAGCT (4)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GAGCGAGCCA (3)
GCCGCCTGGG (3)
GGCACTCATA (3)
TATCATCTTT (2)
TTGGTTAGTT
TTGTGGTGAC (2)
1024.31.0243
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AATTTTTTTT (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGAAAAGCT (4)
CAGACAGTCT (4)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCCGCCTGGG (3)
GCTGGGTGGC (3)
TAACTAGCTG (3)
TAGTGTCCTG (3)
TATCATCTTT (2)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
286.30.2863
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AATTTTTTTT (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCCGCCTGGG (3)
GGCACTCATA (3)
TAACTAGCTG (3)
TATCATCTTT (2)
TGCACTTCCT
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
383.10.3831
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
GCCGCCTGGG (3)
38.50.0385
E15 cortexAAAAAAAAAA (2)
AATTTTTTTT (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGACAGTCT (4)
GAAAAAAAAA (2)
GAGATCAGCT (3)
GCTGGGTGGC (3)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
311.50.3115
P1 cortexAAAAAAAAAA (2)
GAAAAAAAAA (2)
GCCGCCTGGG (3)
GGCACTCATA (3)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
308.90.3089
HypothalamusAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGAAAAGCT (4)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GAGATCAGCT (3)
TGCACTTCCT
TTGTGGTGAC (2)
211.80.2118
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
TAACTAGCTG (3)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
206.60.2066
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGACAGTCT (4)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCTGGGTGGC (3)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
165.70.1657
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGACAGTCT (4)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GAGCGAGCCA (3)
GCTGGGTGGC (3)
TAACTAGCTG (3)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
121.20.1212
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCTGGGTGGC (3)
TAACTAGCTG (3)
TTCTATTCAT (6)
TTGGTTAGTT
TTGTGGTGAC (2)
476.50.4765
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGACAGTCT (4)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
TAACTAGCTG (3)
TAGTGTCCTG (3)
TTGGTTAGTT
TTGTGGTGAC (2)
186.60.1866
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCTGGGTGGC (3)
GGCACTCATA (3)
TAGTGTCCTG (3)
TATCATCTTT (2)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
4770.477
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCCGCCTGGG (3)
GCTGGGTGGC (3)
GGCACTCATA (3)
TAACTAGCTG (3)
TATCATCTTT (2)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
433.90.4339
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCTGGGTGGC (3)
GGCACTCATA (3)
TAACTAGCTG (3)
TATCATCTTT (2)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
395.20.3952
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GAGATCAGCT (3)
GCCGCCTGGG (3)
GCTGGGTGGC (3)
GGCACTCATA (3)
TAACTAGCTG (3)
TAGTGTCCTG (3)
TATCATCTTT (2)
TGCACTTCCT
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
158.20.1582
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGACAGTCT (4)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCCGCCTGGG (3)
GGCACTCATA (3)
TAACTAGCTG (3)
TAGTGTCCTG (3)
TATCATCTTT (2)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
230.60.2306
Adult retinalAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGAAAAGCT (4)
CAGACAGTCT (4)
CAGCATAAAT
GAAAAAAAAA (2)
GCCGCCTGGG (3)
GCTGGGTGGC (3)
TAACTAGCTG (3)
TATCATCTTT (2)
TTCTATTCAT (6)
TTGTGGTGAC (2)
107.70.1077
ONLAAAAAAAAAA (2)
AGGAGATGGA (3)
CAGAAAAGCT (4)
GAAAAAAAAA (2)
GAGCGAGCCA (3)
GCCGCCTGGG (3)
GGCACTCATA (3)
TAACTAGCTG (3)
TTGTGGTGAC (2)
147.30.1473