Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.25059 D13Ertd787eDNA segment, Chr 13, ERATO Doi 787, expressed 13  13 29.0 cM  52680 
 Mm.25059 D13Ertd42eDNA segment, Chr 13, ERATO Doi 42, expressed 13  13 29.0 cM  52475 
 Mm.25059 AU018574expressed sequence AU018574 13    105273 
 Mm.25059 A930104B17RikRIKEN cDNA A930104B17 gene 13    319835 
 Mm.25059 Jarid2jumonji, AT rich interactive domain 2 13  13 27.0 cM  16468 
 Gene Ontology development | DNA binding | intracellular | nucleus
 Human Homolog JARID2[Jumonji, AT rich interactive domain 2]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 119 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGAGAAAAA (6)
GCTGTGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTCTCTGGAA (3)
TTTTAACAAA (6)
40.90.0409
Cb medulloblastomaAAGAGAAAAA (6)
GATGACAGGG (5)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TTCTCTGGAA (3)
TTTTAACAAA (6)
34.60.0346
P8 GC+1d cultureAAGAGAAAAA (6)
ACAGAAGAAA
GATGACAGGG (5)
GCTGAGAAAT (6)
GCTGTGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TATAAGTGTA (5)
TATAAGTGTT (6)
TCACAAGAGA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
38.70.0387
P8 GC+SHH+1d cultureAAGAGAAAAA (6)
AATTTAAAGC (7)
ACAGAAGAAA
GATGACAGGG (5)
GCAAGACAGA (5)
GCGATGGAGA (5)
GCTGAGAAAA (2)
GCTGAGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TCACAAGAGA (5)
TTTTAACAAA (6)
34.10.0341
E15 cortexACAGAAGAAA
GGGGGAAACA (2)
TTCTCTGGAA (3)
19.70.0197
P1 cortexACAGAAGAAA
GCTGTGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TTTTAACAAA (6)
27.10.0271
HypothalamusGCTGAGAAAA (2)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGTA (5)
TATAAGTGTT (6)
TTTTAACAAA (6)
12.60.0126
E12.5 retinaGCGATGGAGA (5)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGTA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
22.60.0226
E14.5 retinaGGGGGAAACA (2)
TATAAGTGTA (5)
TCACAAGAGA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTCTCTGGAA (3)
TTTTAACAAA (6)
21.80.0218
E16.5 retinaAAGAGAAAAA (6)
ACAGAAGAAA
GCTGTGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TTTTAACAAA (6)
32.60.0326
E18.5 retinaAAGAGAAAAA (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGTA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
32.70.0327
P0.5 retinaAATTTAAAGC (7)
GCGATGGAGA (5)
GCTGTGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TATAAGTGTA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTCTCTGGAA (3)
TTTTAACAAA (6)
29.70.0297
P2.5 retinaACAGAAGAAA
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TTCTCTGGAA (3)
TTTTAACAAA (6)
21.30.0213
P4.5 retinaAAGAGAAAAA (6)
GCTGTGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGTT (6)
TTTTAACAAA (6)
25.80.0258
P6.5 retinaACAGAAGAAA
GATGACAGGG (5)
GCTGTGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TATAAGTGTA (5)
TTCTCTGGAA (3)
TTTTAACAAA (6)
21.80.0218
P10.5 crx- retinaAAGAGAAAAA (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TTCTCTGGAA (3)
TTTTAACAAA (6)
280.028
P10.5 crx+ retinaGATGACAGGG (5)
GCAAGACAGA (5)
GCTGAGAAAA (2)
GCTGTGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TTTTAACAAA (6)
40.30.0403
Adult retinalGCGATGGAGA (5)
GCTGAGAAAA (2)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGCT (5)
TTCTCTGGAA (3)
20.60.0206
ONLAATTTAAAGC (7)
GATGACAGGG (5)
GCTGAGAAAT (6)
GGGGGAAACA (2)
TATAAGTGTT (6)
TTTTAACAAA (6)
19.10.0191