Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.254974	5730472N09Rik	RIKEN cDNA 5730472N09 gene	2		108958
Mm.254974	R74766	expressed sequence R74766	16		98044
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 94 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACTGTGGGTG (2) GAGGAACAGC GCTGCCCCCT (3) GCTGGCCTCT (3) GGAAGAGGGA (2) TGTCTATGCC (2) 11.3 0.0113 Cb medulloblastoma GAGGAACAGC GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCTCT (2) TGTCTATGCC (2) 13.8 0.0138 P8 GC+1d culture ACTGTGGGTG (2) GAGGAACAGC GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCTCT (2) GCTGGCCTCT (3) GGGAAGCCCC TTAGCCCTGT (3) 14.7 0.0147 P8 GC+SHH+1d culture GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCTCT (2) GCTGGCCTCT (3) TGTCTATGCC (2) 16.3 0.0163 3T3 fibroblasts GCTGCCCCCT (3) TGTCTATGCC (2) 10.5 0.0105 E15 cortex GAGGAACAGC GCTGGCCTCT (3) 19.7 0.0197 P1 cortex GGAAGAGGGA (2) TCAGAGAAGG (3) TTAGCCCTGT (3) 18.1 0.0181 Hypothalamus ACTGTGGCTG (6) GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCCTC GCTGCCCTCT (2) TGTCTATGCC (2) TTAGCCCTGT (3) 25.2 0.0252 E12.5 retina GAGGAACAGC GCTGCCCTCT (2) GCTGGCCTCT (3) GGAAGAGGGA (2) GGGAAGCCCC TTAGCCCTGT (3) 20.8 0.0208 E14.5 retina ACTGTGGCTG (6) GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCCTC GCTGCCCTCT (2) GCTGGCCTCT (3) GGAAGAGGGA (2) GGAAGCCCGA GGGAAGCCCC 25.4 0.0254 E16.5 retina ACTGTGGGTG (2) GCTGCCCCCT (3) GCTGGCCTCT (3) GGAAGAGGGA (2) GGAAGCCCGA GGGAAGCCCC TGTCTATGCC (2) 30.7 0.0307 E18.5 retina GCTGCCCCTC GCTGCCCTCT (2) GCTGGCCTCT (3) GGAAGAGGGA (2) TGTCTATGCC (2) 10.8 0.0108 P0.5 retina GAGGAACAGC GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCTCT (2) GCTGGCCTCT (3) 8 0.008 P2.5 retina ACTGTGGCTG (6) GCTGCCCCTC GCTGCCCTCT (2) GGAAGAGGGA (2) 10.7 0.0107 P4.5 retina GCTGCCCCTC GGAAGAGGGA (2) TTAGCCCTGT (3) 12 0.012 P6.5 retina GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCCTC GCTGCCCTCT (2) GGAAGAGGGA (2) TGTCTATGCC (2) 13.3 0.0133 P10.5 crx- retina GCTGCCCCCT (3) GCTGGCCTCT (3) TCAGAGAAGG (3) TGTCTATGCC (2) 18.6 0.0186 P10.5 crx+ retina GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCCTC GCTGCCCTCT (2) GGAAGAGGGA (2) TGTCTATGCC (2) 24.9 0.0249 Adult retinal GAGGAACAGC GCTGCCCCCT (3) GCTGCCCCTC GCTGCCCTCT (2) GCTGGCCTCT (3) TGTCTATGCC (2) 24.2 0.0242 ONL GCTGGCCTCT (3) GGGAAGCCCC TCAGAGAAGG (3) 44.1 0.0441