Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.25504	D2Bwg0886e	DNA segment, Chr 2, Brigham & Women's Genetics 0886 expressed	2	2 24.0 cM	52841
Mm.25504	E030004H24Rik	RIKEN cDNA E030004H24 gene	2		319424
Mm.25504	5830434P21Rik	RIKEN cDNA 5830434P21 gene	2	2 B	227723
Human Homolog	KIAA0515[KIAA0515]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 9 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 133 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAGTGGCAG AGAGCAGAGA (5) CACCCCAGCC (4) CTTTCTCAAA (3) GAGAAGCAGC GAGACAGTGT (2) GCCTTTGGTG (4) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) TTCTTGGAAG (2) 29.2 0.0292 Cb medulloblastoma CTTTCTCAAA (3) GAGACAGTGT (2) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) GTTGGAAAAA (3) TGGGGTCTGT 25.3 0.0253 P8 GC+1d culture AGAGCAGAGA (5) CTTTCTCAAA (3) GTTTGGCAAC (3) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT TTTGGCTTTA (4) 22.8 0.0228 P8 GC+SHH+1d culture AAAGTGGCAG AGAGCAGAGA (5) CTTTCTCAAA (3) GGCTTTGGTG (2) TCACAATCCT (3) TCTTTCCCCA (4) TGGGGTCTGT TTTGGCTTTA (4) 33.9 0.0339 3T3 fibroblasts AGAGCAGAGA (5) CACCCCAGCC (4) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) GTTTGGCAAC (3) TCACAATCCT (3) 38.5 0.0385 E15 cortex CACCCCAGCC (4) CTTTCTCAAA (3) GAGAAGCAGC TGGGGTCTGT 19.6 0.0196 P1 cortex AGAGCAGAGA (5) GGCACAGCTG (2) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT TTCTTGGAAG (2) 27.1 0.0271 Hypothalamus AGAGCAGAGA (5) CTTTCTCAAA (3) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT 25.2 0.0252 E12.5 retina CACCCCAGCC (4) CTTTCTCAAA (3) GAGAAGCAGC GGCTTTGGTG (2) TCTTTCCCCA (4) TTTGGCTTTA (4) 17 0.017 E14.5 retina CTCCCAGCGT (3) CTTTCTCAAA (3) GCCTTTGGTG (4) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) GTTGGAAAAA (3) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT TTCTTGGAAG (2) 36.3 0.0363 E16.5 retina AAAGTGGCAG CTCCCAGCGT (3) CTTTCTCAAA (3) GAGACAGTGT (2) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) GTTGGAAAAA (3) TCTTTCCCCA (4) 43.4 0.0434 E18.5 retina CACCCCAGCC (4) CTTTCTCAAA (3) GGCACAGCTG (2) GTTGGAAAAA (3) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT 32.7 0.0327 P0.5 retina AGAGCAGAGA (5) CTCCCAGCGT (3) CTTTCTCAAA (3) GCCTTTGGTG (4) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) GTTTGGCAAC (3) TCACAATCCT (3) TCTTTCCCCA (4) TGGGGTCTGT TTCTTGGAAG (2) 47.3 0.0473 P2.5 retina AGAGCAGAGA (5) CTTTCTCAAA (3) GCCTTTGGTG (4) GGCACAGCTG (2) TCACAATCCT (3) TCTTTCCCCA (4) 17.7 0.0177 P4.5 retina AGAGCAGAGA (5) CACCCCAGCC (4) CTTTCTCAAA (3) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT 19.9 0.0199 P6.5 retina CTCCCAGCGT (3) CTTTCTCAAA (3) GCCTTTGGTG (4) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT TTTGGCTTTA (4) 25.2 0.0252 P10.5 crx- retina CACCCCAGCC (4) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT 24.2 0.0242 P10.5 crx+ retina AGAGCAGAGA (5) CACCCCAGCC (4) CTTTCTCAAA (3) GGCACAGCTG (2) GGCTTTGGTG (2) GTTGGAAAAA (3) TGGGGTCTGT 32.7 0.0327 Adult retinal AGAGCAGAGA (5) CACCCCAGCC (4) CTCCCAGCGT (3) CTTTCTCAAA (3) GAGAAGCAGC GGCACAGCTG (2) TCACAATCCT (3) TGGGGTCTGT TTTGGCTTTA (4) 31.8 0.0318 ONL CTTTCTCAAA (3) TCACAATCCT (3) 7.6 0.0076