Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.25504 D2Bwg0886eDNA segment, Chr 2, Brigham & Women's Genetics 0886 expressed 2  2 24.0 cM  52841 
 Mm.25504 E030004H24RikRIKEN cDNA E030004H24 gene 2    319424 
 Mm.25504 5830434P21RikRIKEN cDNA 5830434P21 gene 2  2 B  227723 
 Human Homolog KIAA0515[KIAA0515]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 9 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 133 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAGTGGCAG
AGAGCAGAGA (5)
CACCCCAGCC (4)
CTTTCTCAAA (3)
GAGAAGCAGC
GAGACAGTGT (2)
GCCTTTGGTG (4)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
TTCTTGGAAG (2)
29.20.0292
Cb medulloblastomaCTTTCTCAAA (3)
GAGACAGTGT (2)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
GTTGGAAAAA (3)
TGGGGTCTGT
25.30.0253
P8 GC+1d cultureAGAGCAGAGA (5)
CTTTCTCAAA (3)
GTTTGGCAAC (3)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
TTTGGCTTTA (4)
22.80.0228
P8 GC+SHH+1d cultureAAAGTGGCAG
AGAGCAGAGA (5)
CTTTCTCAAA (3)
GGCTTTGGTG (2)
TCACAATCCT (3)
TCTTTCCCCA (4)
TGGGGTCTGT
TTTGGCTTTA (4)
33.90.0339
3T3 fibroblastsAGAGCAGAGA (5)
CACCCCAGCC (4)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
GTTTGGCAAC (3)
TCACAATCCT (3)
38.50.0385
E15 cortexCACCCCAGCC (4)
CTTTCTCAAA (3)
GAGAAGCAGC
TGGGGTCTGT
19.60.0196
P1 cortexAGAGCAGAGA (5)
GGCACAGCTG (2)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
TTCTTGGAAG (2)
27.10.0271
HypothalamusAGAGCAGAGA (5)
CTTTCTCAAA (3)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
25.20.0252
E12.5 retinaCACCCCAGCC (4)
CTTTCTCAAA (3)
GAGAAGCAGC
GGCTTTGGTG (2)
TCTTTCCCCA (4)
TTTGGCTTTA (4)
170.017
E14.5 retinaCTCCCAGCGT (3)
CTTTCTCAAA (3)
GCCTTTGGTG (4)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
GTTGGAAAAA (3)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
TTCTTGGAAG (2)
36.30.0363
E16.5 retinaAAAGTGGCAG
CTCCCAGCGT (3)
CTTTCTCAAA (3)
GAGACAGTGT (2)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
GTTGGAAAAA (3)
TCTTTCCCCA (4)
43.40.0434
E18.5 retinaCACCCCAGCC (4)
CTTTCTCAAA (3)
GGCACAGCTG (2)
GTTGGAAAAA (3)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
32.70.0327
P0.5 retinaAGAGCAGAGA (5)
CTCCCAGCGT (3)
CTTTCTCAAA (3)
GCCTTTGGTG (4)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
GTTTGGCAAC (3)
TCACAATCCT (3)
TCTTTCCCCA (4)
TGGGGTCTGT
TTCTTGGAAG (2)
47.30.0473
P2.5 retinaAGAGCAGAGA (5)
CTTTCTCAAA (3)
GCCTTTGGTG (4)
GGCACAGCTG (2)
TCACAATCCT (3)
TCTTTCCCCA (4)
17.70.0177
P4.5 retinaAGAGCAGAGA (5)
CACCCCAGCC (4)
CTTTCTCAAA (3)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
19.90.0199
P6.5 retinaCTCCCAGCGT (3)
CTTTCTCAAA (3)
GCCTTTGGTG (4)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
TTTGGCTTTA (4)
25.20.0252
P10.5 crx- retinaCACCCCAGCC (4)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
24.20.0242
P10.5 crx+ retinaAGAGCAGAGA (5)
CACCCCAGCC (4)
CTTTCTCAAA (3)
GGCACAGCTG (2)
GGCTTTGGTG (2)
GTTGGAAAAA (3)
TGGGGTCTGT
32.70.0327
Adult retinalAGAGCAGAGA (5)
CACCCCAGCC (4)
CTCCCAGCGT (3)
CTTTCTCAAA (3)
GAGAAGCAGC
GGCACAGCTG (2)
TCACAATCCT (3)
TGGGGTCTGT
TTTGGCTTTA (4)
31.80.0318
ONLCTTTCTCAAA (3)
TCACAATCCT (3)
7.60.0076