Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.255822 C78441expressed sequence C78441 3    97065 
 Mm.255822 Camk2dcalcium/calmodulin-dependent protein kinase II, delta 3  3 G2  108058 
 Gene Ontology ATP binding | autophosphorylation | calcium ion transport | G1/S transition of mitotic cell cycle | kinase activity | protein serine/threonine kinase activity | transferase activity
 Human Homolog CAMK2D[calcium/calmodulin-dependent protein kinase (CaM kinase) II delta]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 5 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 104 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGCAAGCTGTT (3)
GGACACTGTA (2)
TAAATAAAAC (3)
6.50.0065
Cb medulloblastomaCTAAGTTAAA (2)
GCAAGCTGTT (3)
GGACACTGTA (2)
GTAGGATCTT (2)
TAAATAAAAC (3)
TATTTAAAAA (4)
TTGATTTGGG (2)
34.60.0346
P8 GC+1d cultureCTAAGTTAAA (2)
GGACACTGTA (2)
TAAATAAAAC (3)
TTGATTTGGG (2)
7.90.0079
P8 GC+SHH+1d cultureCTAAGTTAAA (2)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
GTAGGATCTT (2)
TAAATAAAAC (3)
TATTTAAAAA (4)
TTGATTTGGG (2)
15.30.0153
3T3 fibroblastsGCCATCAGGA (4)
GCCCTGAAAA (4)
10.50.0105
E15 cortexTAAATAAAAC (3)
4.90.0049
P1 cortexAATATACATA (4)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
TAAATAAAAC (3)
TTGATTTGGG (2)
40.80.0408
HypothalamusCAAACTTCCG (2)
CAGTCAAAAA
CTGCTTTTCA (2)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
GGTGTGAAGG (2)
TAAATAAAAC (3)
25.30.0253
E12.5 retinaCAGTCAAAAA
GCCCTGAAAA (4)
GTAGGATCTT (2)
TAAATAAAAC (3)
11.30.0113
E14.5 retinaAATATACATA (4)
CAGTCAAAAA
CTGCTTTTCA (2)
GGACACTGTA (2)
GTAGGATCTT (2)
TAAATAAAAC (3)
27.20.0272
E16.5 retinaCTAAGTTAAA (2)
CTGCTTTTCA (2)
GTAGGATCTT (2)
5.40.0054
E18.5 retinaCCTGTCATTT (2)
GCCATCAGGA (4)
TAAATAAAAC (3)
TATTTAAAAA (4)
21.80.0218
P0.5 retinaGCCCTGAAAA (4)
GTAGGATCTT (2)
TAAATAAAAC (3)
TTGATTTGGG (2)
11.80.0118
P2.5 retinaCCTGTCATTT (2)
GTAAACTGCA (2)
TAAATAAAAC (3)
TACTGTTTTC (2)
TATTTAAAAA (4)
21.20.0212
P4.5 retinaCTAAGTTAAA (2)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
TAAATAAAAC (3)
TACTGTTTTC (2)
17.80.0178
P6.5 retinaAATATACATA (4)
CCTGTCATTT (2)
GCAAGCTGTT (3)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
GGTGTGAAGG (2)
TAAATAAAAC (3)
TACTGTTTTC (2)
TATTTAAAAA (4)
TTGATTTGGG (2)
28.50.0285
P10.5 crx- retinaCTAAGTTAAA (2)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
GGTGTGAAGG (2)
TAAATAAAAC (3)
TATTTAAAAA (4)
TTGATTTGGG (2)
33.50.0335
P10.5 crx+ retinaCTAAGTTAAA (2)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
GGTGTGAAGG (2)
GTAAACTGCA (2)
TTGATTTGGG (2)
30.60.0306
Adult retinalCAAACTTCCG (2)
CTAAGTTAAA (2)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
GGTGTGAAGG (2)
TATTTAAAAA (4)
TTGATTTGGG (2)
31.70.0317
ONLCAAACTTCCG (2)
CAGTCAAAAA
CTAAGTTAAA (2)
GCCCTGAAAA (4)
GGACACTGTA (2)
GGTGTGAAGG (2)
TACTGTTTTC (2)
30.50.0305