Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.25720	Clk3	CDC-like kinase 3	9		102414
Mm.25720	AI256811	expressed sequence AI256811	9		102465
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 76 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) ACAAAACTTT (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) GGTCATATGG (2) 213.6 0.2136 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) 802.4 0.8024 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) TGCTATCACA (2) 209.9 0.2099 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) TGCAGCCTGC TGGTTGGCCA (4) 291.7 0.2917 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) GCCACCAATG TCTGAGAGCC (2) 45.5 0.0455 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) 212.8 0.2128 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) GCCACCAATG 254.4 0.2544 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) ACAAAACTTT (2) CCCAACACTG (2) 132.2 0.1322 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACAAAACTTT (2) CCAGTCTGTG (3) 155.8 0.1558 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) GCCACCAATG TGGTTGGCCA (4) 105.6 0.1056 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACAAAACTTT (2) CCAGTCTGTG (3) TCTGAGAGCC (2) 61.6 0.0616 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) TGGTTGGCCA (4) 389.2 0.3892 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACAAAACTTT (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) TGCTATCACA (2) 133.6 0.1336 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACAAAACTTT (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) TGGTTGGCCA (4) 345 0.345 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) TGCTATCACA (2) TGGTTGGCCA (4) 305.2 0.3052 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) TGGTTGGCCA (4) 285.1 0.2851 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) 48.4 0.0484 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) TGCAGCCTGC 115.3 0.1153 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) CCCAACACTG (2) GGTCATATGG (2) 68.6 0.0686 ONL AAAAAAAAAA (2) CCAGTCTGTG (3) GGTCATATGG (2) TCTGAGAGCC (2) 109.1 0.1091