| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | GATTTCTGCA (2) TATCAATGGG (2) TTGTGTGTGG (3)
| 6.5 | 0.0065 |
| Cb medulloblastoma | ATGTATGCAT (3) TATCAATGGG (2)
| 9.2 | 0.0092 |
| P8 GC+1d culture | AACTGTTTGC (2) ATGTATGCAT (3) ATTTATTCAT (2) GTAGCGAAGG (2)
| 11.3 | 0.0113 |
| P8 GC+SHH+1d culture | ATGTATGCAT (3) TTCTCCAGCC (2) TTGTGTGTGG (3)
| 7.1 | 0.0071 |
| E15 cortex | AACTGTTTGC (2) ATGTATGCAT (3) GTAGCGAAGG (2) TTCTCCAGCC (2)
| 24.6 | 0.0246 |
| Hypothalamus | ATGTATGCAT (3)
| 5.4 | 0.0054 |
| E12.5 retina | ATGTATGCAT (3) ATTTATTCAT (2) TATCAATGGG (2) TGGGAAAATG (2) TTCTCCAGCC (2)
| 18.9 | 0.0189 |
| E14.5 retina | ATGTATGCAT (3) CCAAAAAATA TATCAATGGG (2) TTGTGTGTGG (3)
| 20 | 0.02 |
| E16.5 retina | AACTGTTTGC (2) ATGTATGCAT (3) TATCAATGGG (2)
| 16.3 | 0.0163 |
| E18.5 retina | ATGTATGCAT (3) ATTTATTCAT (2) CCAAAAAATA
| 7.2 | 0.0072 |
| P0.5 retina | ATGTATGCAT (3) TGGGAAAATG (2)
| 5.9 | 0.0059 |
| P2.5 retina | ATGTATGCAT (3) TATCAATGGG (2) TTCTCCAGCC (2)
| 10.6 | 0.0106 |
| P4.5 retina | ATGTATGCAT (3) CCAAAAAATA TATCAATGGG (2)
| 6 | 0.006 |
| P6.5 retina | AACTGTTTGC (2) ATGTATGCAT (3) TATCAATGGG (2) TTGTGTGTGG (3)
| 10.1 | 0.0101 |
| P10.5 crx- retina | ATGTATGCAT (3) GTAGCGAAGG (2) TATCAATGGG (2) TCCTCCAGCC (3) TTGTGTGTGG (3)
| 15 | 0.015 |
| P10.5 crx+ retina | ATGTATGCAT (3) TTGTGTGTGG (3)
| 7.7 | 0.0077 |
| Adult retinal | AACTGTTTGC (2) ATGTATGCAT (3) GATTTCTGCA (2) TATCAATGGG (2) TCCTCCAGCC (3) TTGTGTGTGG (3)
| 24.2 | 0.0242 |
| ONL | ATGTATGCAT (3) GATTTCTGCA (2) TCCTCCAGCC (3) TGGGAAAATG (2) TTGTGTGTGG (3)
| 17.1 | 0.0171 |