Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.260521 6330412C24RikRIKEN cDNA 6330412C24 gene 3    70742 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 103 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTTGAAAAAA (2)
CTTTAACTTT (2)
GATGCTTTGG (2)
GCAGTGAGTG (2)
TCACTAAGTT (5)
TCCTAGAAAA
TCCTCTGTAA
TTATGCCTTA
16.20.0162
Cb medulloblastomaAAGAACCACA (2)
CTTTAACTTT (2)
GATGAAAAAA (4)
GATGCTTTGG (2)
TCACTAAGTT (5)
TCCTAGAAAA
16.10.0161
P8 GC+1d cultureCTTGAAAAAA (2)
GATGCTTTGG (2)
GTACAAATCT (2)
TCCTCTGTAA
TTATGCCTTA
TTTTCCAGAA (3)
12.40.0124
P8 GC+SHH+1d cultureAAGAACCACA (2)
CTTGAAAAAA (2)
CTTTAACTTT (2)
GATGAAAAAA (4)
GCAGTGAGTG (2)
GTACAAATCT (2)
TCCTAGAAAA
TCCTCTGTAA
TGATTGTGCT (2)
TTTTCCAGAA (3)
18.80.0188
3T3 fibroblastsGCAGTGAGTG (2)
3.50.0035
E15 cortexCAAAGAGAAC
GCAGTGAGTG (2)
9.80.0098
P1 cortexTCCCTAAAAA (3)
4.50.0045
HypothalamusCAAAGAGAAC
GATGAAAAAA (4)
TTTTCCAGAA (3)
10.80.0108
E12.5 retinaAATCATTCAA
TTTTCCAGAA (3)
5.70.0057
E14.5 retinaAATCATTCAA
GATGCTTTGG (2)
GCAGTGAGTG (2)
GTACAAATCT (2)
TCCTAGAAAA
14.40.0144
E16.5 retinaGCAGTGAGTG (2)
TCACTAAGTT (5)
TCACTGAGTT
TCCTCTGTAA
TTTTCCAGAA (3)
180.018
E18.5 retinaAATCATTCAA
CTTGAAAAAA (2)
GATGCTTTGG (2)
GCAGTGAGTG (2)
TTTTCCAGAA (3)
10.80.0108
P0.5 retinaAATCATTCAA
GATGAAAAAA (4)
GATGCTTTGG (2)
GCAGTGAGTG (2)
TCACTGAGTT
TCCCTAAAAA (3)
17.70.0177
P2.5 retinaAATCATTCAA
GATGCTTTGG (2)
GTACAAATCT (2)
TCCTAGAAAA
TGATTGTGCT (2)
TTATGCCTTA
TTTTCCAGAA (3)
17.80.0178
P4.5 retinaGCAGTGAGTG (2)
GTACAAATCT (2)
TCCTAGAAAA
TTATGCCTTA
TTTTCCAGAA (3)
19.90.0199
P6.5 retinaCTTTAACTTT (2)
GATGCTTTGG (2)
GTACAAATCT (2)
TCACTAAGTT (5)
TCCCTAAAAA (3)
TTATGCCTTA
TTTTCCAGAA (3)
18.50.0185
P10.5 crx- retinaGATGCTTTGG (2)
TCACTAAGTT (5)
TCCTAGAAAA
TGATTGTGCT (2)
TTTTCCAGAA (3)
16.80.0168
P10.5 crx+ retinaGATGCTTTGG (2)
GCAGTGAGTG (2)
TCACTAAGTT (5)
TCCTAGAAAA
TGATTGTGCT (2)
15.30.0153
Adult retinalAATCATTCAA
CAAAGAGAAC
CTTTAACTTT (2)
GATGCTTTGG (2)
TCACTAAGTT (5)
TCCTAGAAAA
TGATTGTGCT (2)
280.028
ONLGATGCTTTGG (2)
TCACTAAGTT (5)
TCCCTAAAAA (3)
TCCTAGAAAA
TGATTGTGCT (2)
TTATGCCTTA
TTTTCCAGAA (3)
22.90.0229