Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.260931 Orc3lorigin recognition complex, subunit 3-like (S. cerevisiae) 4    50793 
 Mm.260931 C78914expressed sequence C78914 4    97151 
 Mm.260931 AI448984expressed sequence AI448984 4    100124 
 Mm.260931 2700059D21RikRIKEN cDNA 2700059D21 gene 4    67185 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATGAAATTCC (4)
CTAGGCAAGT
GAAACTAAAA (4)
TCCAACTTGC (4)
TCTTCTGCCT (5)
14.60.0146
Cb medulloblastomaAAAGACCACA (4)
ATGAAATTCC (4)
CTAGGCAAGT
TCTTCTGCCT (5)
TTTTCTTTTC (4)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureCAGAGGCTGG (5)
CTAGGCAAGT
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
18.30.0183
P8 GC+SHH+1d cultureAATAAATTCA
CAGAGGCTGG (5)
CCCCCCATCC (4)
CTAGGCAAGT
GAAACTAAAA (4)
GAAACTATAA (4)
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
TCTTCTGCCT (5)
TTTTCTTTTC (4)
16.40.0164
3T3 fibroblastsCAGAGGCTGG (5)
TCCAACTTGC (4)
TCTTCTGCCT (5)
31.50.0315
E15 cortexTCCAACTTGC (4)
14.80.0148
P1 cortexCTAGGCAAGT
GAAACTAAAA (4)
TAACCTCACC (4)
13.50.0135
HypothalamusCAGAGGCTGG (5)
CTAGGCAAGT
3.60.0036
E12.5 retinaAGGAAGAAAC (2)
CTAGGCAAGT
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
TCTTCTGCCT (5)
15.10.0151
E14.5 retinaCAGAGGCTGG (5)
CCCCCCATCC (4)
GAAACTAAAA (4)
GAAACTATAA (4)
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
12.60.0126
E16.5 retinaCAGAGGCTGG (5)
CCCCCCATCC (4)
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
TCTTCTGCCT (5)
TTTTTATTAA (2)
10.80.0108
E18.5 retinaCTAGGCAAGT
GAAACTAAAA (4)
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
12.70.0127
P0.5 retinaAGGAAGAAAC (2)
GAAACTAAAA (4)
GAAACTATAA (4)
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
TCTTCTGCCT (5)
TTTTTATTAA (2)
21.70.0217
P2.5 retinaAAAGACCACA (4)
CCCCCCATCC (4)
GAAACTAAAA (4)
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
TTTTCTTTTC (4)
12.50.0125
P4.5 retinaCCCCCCATCC (4)
GAAACTAAAA (4)
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
13.90.0139
P6.5 retinaCAGAGGCTGG (5)
GAAACTAAAA (4)
GAAACTATAA (4)
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
TTTTCTTTTC (4)
13.40.0134
P10.5 crx- retinaAAAGACCACA (4)
ATGAAATTCC (4)
CCCCCCATCC (4)
GAAACTATAA (4)
TAACCTCACC (4)
TTTTCTTTTC (4)
16.90.0169
P10.5 crx+ retinaAAAGACCACA (4)
CCCCCCATCC (4)
CTAGGCAAGT
GGCTGCCCTG (2)
TCCAACTTGC (4)
15.20.0152
Adult retinalCCCCCCATCC (4)
CTAGGCAAGT
GAAACTATAA (4)
GGCTGCCCTG (2)
TCCAACTTGC (4)
TTTTCTTTTC (4)
TTTTTATTAA (2)
18.70.0187
ONLAATAAATTCA
CTAGGCAAGT
TAACCTCACC (4)
TCCAACTTGC (4)
13.30.0133