Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.262327	Vdac2	voltage-dependent anion channel 2	14	14 2.5 cM	22334
Gene Ontology	anion transport | integral to membrane | mitochondrial outer membrane | mitochondrion | outer membrane | porin activity | voltage-dependent anion channel porin activity | voltage-dependent ion-selective channel activity
Human Homolog	VDAC2[voltage-dependent anion channel 2]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 113 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACAAATTATG (2) CAGCGGTGTG CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT 42.4 0.0424 Cb medulloblastoma ACAAATTATG (2) AGGAGGGAGG CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GCACGGTTTT GGTCAGCTGT TTTGTTTTAT (2) 94.7 0.0947 P8 GC+1d culture ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATATATG (2) GAAATATATT (2) GGTCAGCTGT GGTTAGCTGT 65.1 0.0651 P8 GC+SHH+1d culture ACAAATTATG (2) AGACCAGCAG CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT TTTGTTTTAT (2) 83.2 0.0832 3T3 fibroblasts CAGCGGTGTG CGACCAGCAG GGTTAGCTGT 42 0.042 E15 cortex CGACCAGCAG 4.9 0.0049 P1 cortex ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATATATG (2) 36.3 0.0363 Hypothalamus ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATATATA (2) GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT TTTGTTTTAT (2) 125 0.125 E12.5 retina ACAAATTATG (2) AGGAGGGAGG CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT 84.6 0.0846 E14.5 retina ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GCACGGTTTT GGTTAGCTGT TTTGTTTTAT (2) 105.7 0.1057 E16.5 retina ACAAATTATG (2) CAGCGGTGTG CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATA (2) GAAATATATG (2) GCACGGTTTT GGTTAGCTGT TTTGTTTTAT (2) 124.8 0.1248 E18.5 retina ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GAAATATATT (2) GGTTAGCTGT TTTGTTTTAT (2) 119.9 0.1199 P0.5 retina ACAAATTATG (2) AGGAGGGAGG CGACCAGCAG GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT 53.1 0.0531 P2.5 retina ACAAATTATG (2) AGACCAGCAG CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT 70.5 0.0705 P4.5 retina ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT 99.1 0.0991 P6.5 retina ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT 103.4 0.1034 P10.5 crx- retina ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GAAATATATT (2) GGTTAGCTGT 63.2 0.0632 P10.5 crx+ retina ACAAATTATG (2) AGACCAGCAG CAGCGGTGTG CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) TTTGTTTTAT (2) 74.9 0.0749 Adult retinal ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATAAAAT (2) GAAATATATG (2) GGTTAGCTGT 50.2 0.0502 ONL ACAAATTATG (2) CGACCAGCAG GAAATATATG (2) GGTCAGCTGT GGTTAGCTGT 51.7 0.0517