Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.263396 4633401G24RikRIKEN cDNA 4633401G24 gene 8    70812 
 Mm.263396 Itgb1integrin beta 1 (fibronectin receptor beta) 8    16412 
 Gene Ontology cell adhesion | cell-matrix adhesion | extracellular space | G1/S transition of mitotic cell cycle | integral to membrane | integrin complex | integrin-mediated signaling pathway | metabolism | oxidoreductase activity | plasma membrane | protein binding | receptor activity | regulation of cell cycle | synaptosome
 Human Homolog ITGB1[integrin, beta 1 (fibronectin receptor, beta polypeptide, antigen CD29 includes MDF2, MSK12)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 121 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTGAATTTC
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGACTGTTCT (2)
37.40.0374
Cb medulloblastomaACTGATTTTC (4)
CAGGAGCGGA (2)
CTGTGTTTCA (2)
TCAGACCTGC (3)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureACTGAATTTC
ACTGATTTTC (4)
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
GTGGACAAGG
TGACTGTTCT (2)
TGCAGGTGCA (2)
62.70.0627
P8 GC+SHH+1d cultureACTGATTTTC (4)
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
GTGGACAAGG
TGACTGTTCT (2)
TGCAGGTGCA (2)
74.90.0749
3T3 fibroblastsCAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
115.60.1156
E15 cortexAGCAAATCAA (2)
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
GTGGACAAGG
54.30.0543
P1 cortexCAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
18.10.0181
HypothalamusACTGAATTTC
CAGGAGCGGA (2)
CTGTGTTTCA (2)
TGCAGGTGCA (2)
16.20.0162
E12.5 retinaACTGATTTTC (4)
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
GATTATAACA (2)
TGCAGGTGCA (2)
56.40.0564
E14.5 retinaACTGAATTTC
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
GCATTCCAGC (2)
56.60.0566
E16.5 retinaACTGAATTTC
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
57.80.0578
E18.5 retinaACTGAATTTC
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
GAAAAATTCT (2)
TGCAGGTGCA (2)
52.70.0527
P0.5 retinaACTGAATTTC
ACTGATTTTC (4)
AGCAAATCAA (2)
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTGTGTTTCA (2)
TGCAGGTGCA (2)
550.055
P2.5 retinaAGCAAATCAA (2)
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
35.20.0352
P4.5 retinaACTGATTTTC (4)
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
37.70.0377
P6.5 retinaACTGAATTTC
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
GATTATAACA (2)
TGCAGGTGCA (2)
350.035
P10.5 crx- retinaACTGATTTTC (4)
CAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
20.60.0206
P10.5 crx+ retinaCAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
28.80.0288
Adult retinalCAGGAGCGGA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTGTGTTTCA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
18.60.0186
ONLAGCAAATCAA (2)
CAGGAGCGGA (2)
CCTCAAAAAA (2)
CTGTGTTTCA (2)
GAAAAATTCT (2)
TGCAGGTGCA (2)
15.20.0152