| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 21.3 | 0.0213 |
| Cb medulloblastoma | TTAAAAAAAA (2)
| 53.2 | 0.0532 |
| P8 GC+1d culture | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 31.9 | 0.0319 |
| P8 GC+SHH+1d culture | TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 35.2 | 0.0352 |
| 3T3 fibroblasts | CCAAGGACAG
| 10.5 | 0.0105 |
| E15 cortex | TTAAAAAAAA (2)
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 18.1 | 0.0181 |
| Hypothalamus | CCAAGGACAG TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 28.9 | 0.0289 |
| E12.5 retina | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2)
| 15.1 | 0.0151 |
| E14.5 retina | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2)
| 25.5 | 0.0255 |
| E16.5 retina | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2)
| 23.5 | 0.0235 |
| E18.5 retina | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2)
| 52.7 | 0.0527 |
| P0.5 retina | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 23.6 | 0.0236 |
| P2.5 retina | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 49.3 | 0.0493 |
| P4.5 retina | CCAAGGACAG TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 57.5 | 0.0575 |
| P6.5 retina | CCAAGGACAG TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 30 | 0.03 |
| P10.5 crx- retina | CCAAGGACAG TTAAAAAAAA (2)
| 14.9 | 0.0149 |
| P10.5 crx+ retina | TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2)
| 11.6 | 0.0116 |
| Adult retinal | CCAAGGACAG TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 18.6 | 0.0186 |
| ONL | CCAAGGACAG TAGGTGCTGG TTAAAAAAAA (2) TTTTGTATCA
| 17.2 | 0.0172 |