Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.26579	Ttn	titin	2	2 44.0 cM	22138
Mm.26579	2610301F02Rik	RIKEN cDNA 2610301F02 gene	2		72485
Mm.26579	AF006999	EST AF006999			50726
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 71 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) 114.2 0.1142 Cb medulloblastoma GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) 136.4 0.1364 P8 GC+1d culture GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TTAATTAAGT 43.4 0.0434 P8 GC+SHH+1d culture GTAGCTCACA (3) TCAGAAGGCT (3) TGGATCCTGA (5) TTAATTAAGT 24.6 0.0246 3T3 fibroblasts GTAGCTCACA (3) TCAGAAGGCT (3) 21 0.021 E15 cortex ACAGAGAAAA (3) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) 202.8 0.2028 P1 cortex AGGGCTGTGT (2) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) 31.7 0.0317 Hypothalamus ATGTTAGAAA (3) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) 81.5 0.0815 E12.5 retina GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TTAATTAAGT 39.4 0.0394 E14.5 retina GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TGGGTCTGGA TTAATTAAGT 76.5 0.0765 E16.5 retina GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) 65.2 0.0652 E18.5 retina GTAGCTCACA (3) TTAATTAAGT 23.7 0.0237 P0.5 retina AGGGCTGTGT (2) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TTAATTAAGT 35.4 0.0354 P2.5 retina ACAGAGAAAA (3) AGGGCTGTGT (2) ATGTTAGAAA (3) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TTAATTAAGT 35.4 0.0354 P4.5 retina ACAGAGAAAA (3) AGGGCTGTGT (2) ATGTTAGAAA (3) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TGGGTCTGGA TTAATTAAGT 37.8 0.0378 P6.5 retina AGGGCTGTGT (2) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TGGGTCTGGA 33.4 0.0334 P10.5 crx- retina AGGGCTGTGT (2) GTAGCTCACA (3) TCAGAAGGCT (3) TGGATCCTGA (5) TGGGTCTGGA 130.1 0.1301 P10.5 crx+ retina GTAGCTCACA (3) TCAGAAGGCT (3) TGGATCCTGA (5) TGGGTCTGGA 88.4 0.0884 Adult retinal AGGGCTGTGT (2) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TGGGTCTGGA 81.5 0.0815 ONL AGGGCTGTGT (2) GTAGCTCACA (3) TGGATCCTGA (5) TGGGTCTGGA 51.7 0.0517