Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.26908 AI314760expressed sequence AI314760 18    106885 
 Mm.26908 Csnk1a1casein kinase 1, alpha 1 18  18 D3  93687 
 Gene Ontology ATP binding | cellular_component unknown | protein amino acid phosphorylation | protein kinase activity | protein serine/threonine kinase activity | transferase activity | Wnt receptor signaling pathway
 Human Homolog CSNK1A1[casein kinase 1, alpha 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 184 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGCTGCCAC
ATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGAGAGACAA (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TCTGTACTCT
37.60.0376
Cb medulloblastomaAACTGCAGAG (2)
ATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
GAATCTTTAG (3)
GAGTTAATTA (2)
GGCTGTCCTG (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TGGTTGTGAA (2)
43.80.0438
P8 GC+1d cultureAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAGTTAATTA (2)
GCGAGGAGTG
GGAGAGACAA (2)
GGCTGTCCTG (2)
GTGGCTCATT (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TCAAGATAAA (2)
TGGTTGTGAA (2)
TTTGGTAAGA (2)
61.50.0615
P8 GC+SHH+1d cultureAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
AAGCTGCCAC
ATTACAGACA (4)
ATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAGTTAATTA (2)
GCGAGGAGTG
GGAGAGACAA (2)
GGCTGTCCTG (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TGGTTGTGAA (2)
63.40.0634
3T3 fibroblastsAAGCCCAAAG (2)
ATTTATCACA (2)
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGAGAGACAA (2)
GGCTGTCCTG (2)
TATGTGTGTT (2)
770.077
E15 cortexAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
TATGTGTGTT (2)
740.074
P1 cortexAACTGCAGAG (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAATCTTTAG (3)
GCGAGGAGTG
GGAGAGACAA (2)
GGCTGTCCTG (2)
GTGGCTCATT (2)
63.40.0634
HypothalamusAACTGCAGAG (2)
ATTTATCACA (2)
CTTGTCAGTT (2)
GAGTTAATTA (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
TATGTGTGTT (2)
TTTGGTAAGA (2)
30.60.0306
E12.5 retinaAACTGCAGAG (2)
ATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
GTGGCTCATT (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
37.70.0377
E14.5 retinaAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
AAGCTGCCAC
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
TATGTGTGTT (2)
TCAAGATAAA (2)
TCTGTACTCT
TTTGGTAAGA (2)
290.029
E16.5 retinaAACTGCAGAG (2)
ATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
TATGTGTGTT (2)
TCTGTACTCT
32.50.0325
E18.5 retinaAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TCTGTACTCT
36.20.0362
P0.5 retinaAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
ATTACAGACA (4)
ATTTATCACA (2)
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
TATGTGTGTT (2)
70.60.0706
P2.5 retinaAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
GAATCTTTAG (3)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TTTGGTAAGA (2)
460.046
P4.5 retinaAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
ATTACAGACA (4)
ATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
51.70.0517
P6.5 retinaAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
ATTACAGACA (4)
ATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
TATGTGTGTT (2)
TCAAGATAAA (2)
TCTGTACTCT
TGGTTGTGAA (2)
TTTGGTAAGA (2)
670.067
P10.5 crx- retinaAACTGCAGAG (2)
ATTACAGACA (4)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAATCTTTAG (3)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TCAAGATAAA (2)
61.40.0614
P10.5 crx+ retinaAACTGCAGAG (2)
AAGCCCAAAG (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAGTTAATTA (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TGGTTGTGAA (2)
51.70.0517
Adult retinalATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
83.40.0834
ONLAACTGCAGAG (2)
AAGCTGCCAC
ATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GCGAGGAGTG
GGCTGTCCTG (2)
GTGGCTCATT (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
38.20.0382