Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.269993	1500009M05Rik	RIKEN cDNA 1500009M05 gene	3		67006
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 76 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) 24.4 0.0244 Cb medulloblastoma GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGAATACTGG TGTGTGTGCA (2) TGTGTTGTGC 39.3 0.0393 P8 GC+1d culture ATTATCCCAA GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) TGTGTTGTGC 45.7 0.0457 P8 GC+SHH+1d culture GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) TGTGTTGTGC 37.5 0.0375 3T3 fibroblasts GTAGCTCACA (3) TGTGTTGTGC 17.5 0.0175 E15 cortex GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT 34.6 0.0346 P1 cortex GTAGCTCACA (3) TGTGTTGTGC 18.1 0.0181 Hypothalamus GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) 47.1 0.0471 E12.5 retina ATTATCCCAA GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) 45.1 0.0451 E14.5 retina AGTGGAGTGA (2) CCTGGTGCCC (2) GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGAATACTGG TGTGTGTGCA (2) 54.6 0.0546 E16.5 retina GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGAATACTGG TGTGTGTGCA (2) TGTGTTGTGC 54.3 0.0543 E18.5 retina ATTATCCCAA GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTTGTGC 40 0.04 P0.5 retina ATTATCCCAA CCTGGTGCCC (2) GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) TGTGTTGTGC 47.1 0.0471 P2.5 retina ATTATCCCAA GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTTGTGC 42.3 0.0423 P4.5 retina AGTGGAGTGA (2) GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) 39.7 0.0397 P6.5 retina GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) 28.3 0.0283 P10.5 crx- retina AGTGGAGTGA (2) CCTGGTGCCC (2) GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) TGTGTTGTGC 31.7 0.0317 P10.5 crx+ retina GTAGCTCACA (3) 28.8 0.0288 Adult retinal GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) TGTGTTGTGC 29.7 0.0297 ONL GTAGCTCACA (3) TAAGAGCTAT TGTGTGTGCA (2) 32.5 0.0325