| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CCTTTAATCC (3) GGAAGACAGC (2) TACCACCACA (2) TACCACCACG
| 58.7 | 0.0587 |
| Cb medulloblastoma | CCTTTAATCC (3) TACCACCACA (2)
| 43.9 | 0.0439 |
| P8 GC+1d culture | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3) TACCACCACA (2)
| 39.9 | 0.0399 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3)
| 27 | 0.027 |
| 3T3 fibroblasts | CCTTTAATCC (3)
| 70.1 | 0.0701 |
| E15 cortex | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3)
| 59.3 | 0.0593 |
| P1 cortex | CCTTTAATCC (3)
| 154.5 | 0.1545 |
| Hypothalamus | CCTTTAATCC (3) TACCACCACG
| 21.7 | 0.0217 |
| E12.5 retina | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3)
| 77 | 0.077 |
| E14.5 retina | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3)
| 123.9 | 0.1239 |
| E16.5 retina | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3)
| 70.6 | 0.0706 |
| E18.5 retina | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3) GGAAGACAGC (2) TACCACCACA (2)
| 34.5 | 0.0345 |
| P0.5 retina | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3)
| 82.4 | 0.0824 |
| P2.5 retina | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3) TACCACCACA (2)
| 77.5 | 0.0775 |
| P4.5 retina | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3)
| 49.5 | 0.0495 |
| P6.5 retina | CACCTCACCA (2) CCTTTAATCC (3)
| 71.7 | 0.0717 |
| P10.5 crx- retina | CCTTTAATCC (3) TACCACCACA (2)
| 65.1 | 0.0651 |
| P10.5 crx+ retina | CCTTTAATCC (3)
| 38.4 | 0.0384 |
| Adult retinal | CCTTTAATCC (3)
| 129.6 | 0.1296 |
| ONL | CCTTTAATCC (3) GGAAGACAGC (2) TACCACCACG
| 88.1 | 0.0881 |