| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | GAATATGGAA (2) GCTTCCCCAG TAAATTAAGA (4)
| 6.5 | 0.0065 |
| P8 GC+1d culture | ATATTTTTAA (2) GAATATGGAA (2) TAAATTAAGA (4)
| 14.8 | 0.0148 |
| P8 GC+SHH+1d culture | ATATTTTTAA (2) GAATATGGAA (2) TAAATTAAGA (4)
| 5.9 | 0.0059 |
| E15 cortex | GCTTCCCCAG
| 4.9 | 0.0049 |
| Hypothalamus | TAAATTAAGA (4)
| 10.9 | 0.0109 |
| E12.5 retina | GAATATGGAA (2) TAAATTAAGA (4)
| 7.6 | 0.0076 |
| E14.5 retina | GAATATGGAA (2) TAAATTAAGA (4)
| 7.2 | 0.0072 |
| E16.5 retina | ATATTTTTAA (2) TAAATTAAGA (4)
| 3.6 | 0.0036 |
| E18.5 retina | ATATTTTTAA (2)
| 1.8 | 0.0018 |
| P0.5 retina | GAATATGGAA (2) TAAATTAAGA (4)
| 5.9 | 0.0059 |
| P2.5 retina | GAATATGGAA (2) TAAATTAAGA (4)
| 3.6 | 0.0036 |
| P4.5 retina | ATATTTTTAA (2) GCTTCCCCAG
| 4 | 0.004 |
| P6.5 retina | TAAATTAAGA (4)
| 5 | 0.005 |
| P10.5 crx- retina | GAATATGGAA (2)
| 5.6 | 0.0056 |
| P10.5 crx+ retina | GAATATGGAA (2) TAAATTAAGA (4)
| 5.7 | 0.0057 |
| Adult retinal | GAATATGGAA (2)
| 1.9 | 0.0019 |
| ONL | GAATATGGAA (2)
| 1.9 | 0.0019 |