| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | TATGTGGTTT
| 1.6 | 0.0016 |
| P8 GC+1d culture | CAACAACGTC TATGTGGTTT TTTACTTTCA
| 10.3 | 0.0103 |
| P8 GC+SHH+1d culture | GGTGCTTTCA TATGTGGTTT TTTACTTTCA
| 7.1 | 0.0071 |
| 3T3 fibroblasts | GGTGCTTTCA
| 3.5 | 0.0035 |
| P1 cortex | TATGTGGTTT
| 4.5 | 0.0045 |
| Hypothalamus | GCAGACTAAA GGATTTGGGC GGTGCTTTCA TATGTGGTTT
| 9 | 0.009 |
| E12.5 retina | GGTGCTTTCA TATGTGGTTT TTTACTTTCA
| 5.7 | 0.0057 |
| E14.5 retina | TATGTGGTTT TGCTTTAGAA (2) TTTACTTTCA
| 7.2 | 0.0072 |
| E16.5 retina | CAACAACGTC GGTGCTTTCA TATGTGGTTT
| 10.8 | 0.0108 |
| E18.5 retina | GCAGACTAAA TATGTGGTTT TTTACTTTCA
| 9 | 0.009 |
| P0.5 retina | GGATTTGGGC GGTGCTTTCA TATGTGGTTT
| 13.8 | 0.0138 |
| P2.5 retina | GGATTTGGGC GGTGCTTTCA TATGTGGTTT TTTACTTTCA
| 35.2 | 0.0352 |
| P4.5 retina | GCAGACTAAA GGATTTGGGC TATGTGGTTT TTTACTTTCA
| 25.8 | 0.0258 |
| P6.5 retina | CAACAACGTC GGTGCTTTCA TATGTGGTTT TTTACTTTCA
| 43.4 | 0.0434 |
| P10.5 crx- retina | GGTGCTTTCA TATGTGGTTT TCTGTGGTAG (2)
| 29.7 | 0.0297 |
| P10.5 crx+ retina | CAACAACGTC GCAGACTAAA TATGTGGTTT TCTGTGGTAG (2) TTTACTTTCA
| 24.9 | 0.0249 |
| Adult retinal | GCAGACTAAA TATGTGGTTT TCTGTGGTAG (2) TGCTTTAGAA (2)
| 11.2 | 0.0112 |
| ONL | GCAGACTAAA GGATTTGGGC GGTGCTTTCA TATGTGGTTT TCTGTGGTAG (2) TTTACTTTCA
| 15.2 | 0.0152 |