Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.274433 BC003965cDNA sequence BC003965 17    214489 
 Mm.274433 4930568E02RikRIKEN cDNA 4930568E02 gene 17    75872 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 48 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTAGGCTGT (2)
CAGCTGGCTT (2)
TTCTTTTGAG (2)
6.50.0065
Cb medulloblastomaCAGGTGGGTT (3)
2.30.0023
P8 GC+1d cultureATTAGGCTGT (2)
CAGGTGGGTT (3)
GCTCCGGGTT (2)
TAGGTTCTGG
TTTCCAGCGT (2)
7.80.0078
P8 GC+SHH+1d cultureCAGCTGGCTT (2)
TTTCCAGCGT (2)
4.70.0047
3T3 fibroblastsCAGGTGGGTT (3)
3.50.0035
E15 cortexAGAACTTAAA (3)
4.90.0049
P1 cortexCAGGTGGGTT (3)
4.50.0045
HypothalamusCAGCTGGCTT (2)
TTCTTTTGAG (2)
TTTCCAGCGT (2)
5.40.0054
E12.5 retinaCAGCTGGCTT (2)
TTTCCAGCGT (2)
5.70.0057
E14.5 retinaAGAACTTAAA (3)
CAGGTGGGTT (3)
TTTCCAGCGT (2)
7.20.0072
E16.5 retinaAGAACTTAAA (3)
TTTCCAGCGT (2)
5.40.0054
E18.5 retinaCAGCTGGCTT (2)
CAGGTGGGTT (3)
TAGGTTCTGG
TTTCCAGCGT (2)
90.009
P0.5 retinaATTAGGCTGT (2)
TTTCCAGCGT (2)
40.004
P2.5 retinaATTAGGCTGT (2)
CAGGTGGGTT (3)
7.10.0071
P4.5 retinaCAGGTGGGTT (3)
TAGGTTCTGG
TTCTTTTGAG (2)
60.006
P6.5 retinaCAGGTGGGTT (3)
GCTCCGGGTT (2)
8.40.0084
P10.5 crx- retinaATTAGGCTGT (2)
CAGCTGGCTT (2)
TTTCCAGCGT (2)
9.40.0094
P10.5 crx+ retinaGCTCCGGGTT (2)
TAGGTTCTGG
5.70.0057
Adult retinalGCTCCGGGTT (2)
TAGGTTCTGG
TTCTTTTGAG (2)
TTTCCAGCGT (2)
9.40.0094
ONLCAGCTGGCTT (2)
TTTCCAGCGT (2)
3.80.0038