Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.274579 1110046J11RikRIKEN cDNA 1110046J11 gene 16    68812 
 Mm.274579 4930429H24RikRIKEN cDNA 4930429H24 gene 16    75785 
 Gene Ontology ion channel activity
 Human Homolog DRE1[DRE1 protein]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 70 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
TTTATTGCAG (2)
14.60.0146
Cb medulloblastomaGCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TTTATTGCAG (2)
16.20.0162
P8 GC+1d cultureGCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
TGTGCCTGTA (2)
TGTGTGGTTG
21.70.0217
P8 GC+SHH+1d cultureGAGAACACTC (3)
GCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
19.80.0198
3T3 fibroblastsTGGGTGCTGA (2)
TGTGCCTGTA (2)
70.007
E15 cortexGCAGTTCACA
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
49.40.0494
P1 cortexGCAGTTCACA
TTTATTGCAG (2)
90.009
HypothalamusATGGTGGAAA (3)
GAGAACACTC (3)
GCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TGGGTGCTGA (2)
180.018
E12.5 retinaGCAGTTCACA
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
9.50.0095
E14.5 retinaGAGAACACTC (3)
GCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TGGGTGCTGA (2)
16.40.0164
E16.5 retinaGCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
21.60.0216
E18.5 retinaGCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TGGGTGCTGA (2)
TGTGCCTGTA (2)
16.40.0164
P0.5 retinaGCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TGGGTGCTGA (2)
21.70.0217
P2.5 retinaTCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
10.60.0106
P4.5 retinaGCAGTTCACA
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
17.90.0179
P6.5 retinaGCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
18.40.0184
P10.5 crx- retinaTCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
37.20.0372
P10.5 crx+ retinaGCAGTTCACA
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
24.90.0249
Adult retinalTCCATTCATA (2)
TCCTTGTTCT (2)
TGGGTGCTGA (2)
7.50.0075
ONLGCAGTTCACA
TCCATTCATA (2)
TGGGTGCTGA (2)
TTTATTGCAG (2)
15.20.0152