Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.274690 D930017J03RikRIKEN cDNA D930017J03 gene 14    320391 
 Mm.274690 Hnrpcheterogeneous nuclear ribonucleoprotein C 14  14 20.0 cM  15381 
 Gene Ontology nucleus | pronucleus | ribonucleoprotein complex | RNA binding | RNA splicing | viral nucleocapsid
 Human Homolog HNRPC[heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 186 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATTCCCGTG (2)
ACTTCATAGT (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
CCTTTAATCC (3)
GAGTCTGAGG
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
177.90.1779
Cb medulloblastomaATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GAGTCTGAGG
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
196.40.1964
P8 GC+1d cultureAAAGCATAAA
AAAGCATAGA (2)
AATTAATGAA (2)
AATTAGTGAA
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
139.10.1391
P8 GC+SHH+1d cultureAATTCCCGTG (2)
ACTTCATAGT (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
CCTTTAATCC (3)
GAGTCTGAGG
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
178.10.1781
3T3 fibroblastsATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
339.90.3399
E15 cortexATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCAAATGCAT
TCATATCTGT (3)
TGGTTGCTGG
3710.371
P1 cortexAATTAGTGAA
CATACCAATA (2)
CCTTTAATCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
263.40.2634
HypothalamusATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
394.80.3948
E12.5 retinaAATTCCCGTG (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
CCTTTAATCC (3)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
281.70.2817
E14.5 retinaAAAGCATAAA
AAAGGCTTTG (2)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GAGTCTGAGG
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
1100.31.1003
E16.5 retinaAAAGGCTTTG (2)
ACTTCATAGT (2)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
CCTTTAATCC (3)
GAGTCTGAGG
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCAAATGCAT
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
861.90.8619
E18.5 retinaAAAGCATAGA (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCAAATGCAT
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
341.90.3419
P0.5 retinaAATTCCCGTG (2)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCAAATGCAT
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
304.40.3044
P2.5 retinaAAAGCATAAA
AAAGCATAGA (2)
AAAGGCTTTG (2)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
267.70.2677
P4.5 retinaAATTCCCGTG (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
233.80.2338
P6.5 retinaAATTAATGAA (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
CCTTTAATCC (3)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
281.90.2819
P10.5 crx- retinaAAAGCATAGA (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
CCTTTAATCC (3)
GGATTTGGCC (3)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
379.10.3791
P10.5 crx+ retinaAATTCCCGTG (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GAGTCTGAGG
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
192.10.1921
Adult retinalAATTAATGAA (2)
ACTTCATAGT (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
TTGCTGCGGC (2)
372.40.3724
ONLAATTAATGAA (2)
AATTAGTGAA
ATTGCCCTGC (2)
CCTTTAATCC (3)
GGATTTGGCC (3)
TCAAATGCAT
TGAAGTACTC (3)
TGGTTGCTGG
526.60.5266