Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.274926 A430106F12RikRIKEN cDNA A430106F12 gene 13    77934 
 Mm.274926 Embembigin 13    13723 
 Gene Ontology integral to membrane
 Human Homolog MGC71745[similar to embigin]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 159 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACAGGCTCA (2)
GAAACTTGTC (2)
GAAGGCATCT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGAAAAAAAG (2)
GGAAACAAAA (3)
GGGAAAAAAA (5)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TGCGGAAAAA (2)
TGGAGCTGGG
TGTTTGTGTT (3)
40.80.0408
Cb medulloblastomaAACAGGCTCA (2)
GAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGAAACAAAA (3)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
TCCTGTGGGT
TGGAGCTGGG
TTCTACTTAA (2)
166.40.1664
P8 GC+1d cultureAACAAGCTCA
AGCCACCACA
CAGGTAGCCG (2)
GAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TGGAGCTGGG
TTCTACTTAA (2)
TTTTTTTTTG (3)
23.70.0237
P8 GC+SHH+1d cultureAACAAGCTCA
AACAGGCTCA (2)
GAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
GGTACTGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TGCGGAAAAA (2)
TTCTACTTAA (2)
TTTTTTTTTG (3)
29.30.0293
3T3 fibroblastsAGCCACCACA
TCCCTGTGGG (2)
210.021
E15 cortexGGAAAAAAAA (2)
TGCGGAAAAA (2)
14.80.0148
P1 cortexGGAAAAAAAA (2)
GGAAACAAAA (3)
GGGAAAAAAA (5)
TTTTTTTTTG (3)
180.018
HypothalamusAACAAGCTCA
AGCCACCACA
GAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
GGTACTGAAA (2)
TCCTGTGGGT
TTTTTTTTTG (3)
70.60.0706
E12.5 retinaGAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGTAATGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TGGAGCTGGG
18.90.0189
E14.5 retinaAACAAGCTCA
GAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
GGTACTGAAA (2)
TCCTGTGGGT
TGCGGAAAAA (2)
32.60.0326
E16.5 retinaAGCCACCACA
GAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGAAACAAAA (3)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
TCCTGTGGGT
TTCTACTTAA (2)
TTTTTTTTTG (3)
25.20.0252
E18.5 retinaGAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGAAACAAAA (3)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TGCGGAAAAA (2)
TGGAGCTGGG
TTCTACTTAA (2)
45.30.0453
P0.5 retinaAACAAGCTCA
AGCCACCACA
GAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TGTTTGTGTT (3)
37.30.0373
P2.5 retinaAGCCACCACA
GAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGAAAAAAAG (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
GGTACTGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TTCTACTTAA (2)
TTTTTTTTTG (3)
40.60.0406
P4.5 retinaGAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TTTTTTTTTG (3)
51.60.0516
P6.5 retinaCAGGTAGCCG (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TTTTTTTTTG (3)
43.40.0434
P10.5 crx- retinaAACAGGCTCA (2)
CAGGTAGCCG (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TTTTTTTTTG (3)
27.90.0279
P10.5 crx+ retinaGAAACTTGTC (2)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
TCCTGTGGGT
TTTTTTTTTG (3)
46.10.0461
Adult retinalAACAAGCTCA
GAAGGCATCT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTACTGAAA (2)
TCCCTGTGGG (2)
TCCTGTGGGT
TTCTACTTAA (2)
540.054
ONLAACAGGCTCA (2)
AGCCACCACA
CAGGTAGCCG (2)
GAAACTTGTC (2)
GAAGGCATCT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGGAAAAAAA (5)
GGTAATGAAA (2)
TCCTGTGGGT
TGTTTGTGTT (3)
TTTTTTTTTG (3)
68.70.0687