Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.274995 SnurfSNRPN upstream reading frame 7    84704 
 Mm.274995 Snrpnsmall nuclear ribonucleoprotein N 7  7 29.0 cM  20646 
 Gene Ontology nucleus | ribonucleoprotein complex | spliceosome complex | viral nucleocapsid
 Human Homolog SNURF[SNRPN upstream reading frame]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 102 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTGTGGGTA (2)
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
GACCCCCCCC
130.013
Cb medulloblastomaACCCACAAGA
ACTGTGGGTA (2)
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
GACCCCCCCC
20.80.0208
P8 GC+1d cultureACCCACAAGA
CAGAGCCACC (3)
CAGAGCCCAC (2)
CCCCACCCAT (3)
CCTCCTCCAG (2)
CTTTTTGTGA (2)
GACCCCCCCC
34.10.0341
P8 GC+SHH+1d cultureACCCACAAGA
CAGAGCCACC (3)
CAGAGCCCAC (2)
CAGGCCACCA
CCTCCTCCAG (2)
CTCTGTGAAT (2)
CTTTTTGTGA (2)
GACCCCCCCC
43.30.0433
3T3 fibroblastsCCTCCTCCAG (2)
70.007
E15 cortexCAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
GACCCCCCCC
69.20.0692
P1 cortexCAGAGCCACC (3)
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
GACCCCCCCC
45.40.0454
HypothalamusACCCACAAGA
ACCCCACAGG (2)
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
CTCTGTGAAT (2)
GGTGGTCTCA (2)
TACTGGGTCT (2)
45.20.0452
E12.5 retinaCCTCCTCCAG (2)
1.90.0019
E14.5 retinaACTGTGGAGG (2)
CAGAGCCCAC (2)
CCCCACCCAT (3)
CCTCCTCCAG (2)
CCTCCTCCGG (3)
TACTGGGTCT (2)
19.90.0199
E16.5 retinaCAGAGCCCAC (2)
CCCCACCCAT (3)
CCTCCTCCAG (2)
CTCTGTGAAT (2)
GGTGGTCTCA (2)
290.029
E18.5 retinaACTGTGGAGG (2)
CAGAGCCCAC (2)
CAGGCCACCA
CCTCCTCCAG (2)
GACCCCCCCC
12.70.0127
P0.5 retinaACCCCACAGG (2)
ACTGTGGAGG (2)
ACTGTGGGTA (2)
CAGAGCCCAC (2)
CCCCACCCAT (3)
CCTCCTCCAG (2)
CTTTTTGTGA (2)
17.80.0178
P2.5 retinaACCCACAAGA
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
CTTTTTGTGA (2)
TACTGGGTCT (2)
19.50.0195
P4.5 retinaCAGAGCCACC (3)
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
TACTGGGTCT (2)
13.90.0139
P6.5 retinaACCCACAAGA
ACTGTGGGTA (2)
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
CCTCCTCCGG (3)
350.035
P10.5 crx- retinaACCCACAAGA
ACCCCACAGG (2)
ACTGTGGGTA (2)
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
CTTTTTGTGA (2)
GACCCCCCCC
GGTGGTCTCA (2)
55.90.0559
P10.5 crx+ retinaACCCACAAGA
CAGAGCCACC (3)
CAGAGCCCAC (2)
CCTCCTCCAG (2)
TACTGGGTCT (2)
24.90.0249
Adult retinalACCCACAAGA
ACCCCACAGG (2)
CAGAGCCCAC (2)
CCCCACCCAT (3)
CCTCCTCCAG (2)
CCTCCTCCGG (3)
CTCTGTGAAT (2)
GACCCCCCCC
TACTGGGTCT (2)
540.054
ONLCAGAGCCCAC (2)
CAGGCCACCA
CCTCCTCCGG (3)
9.50.0095