Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.275893	AI595338	expressed sequence AI595338	5		100702
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 91 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCCCACCCCA (2) CTCAACTTGT (3) GGAGGTGGAG (2) GTGACTCATA TAGCCCAGGA (2) 21.2 0.0212 Cb medulloblastoma ATGATACATA CCCCACCCCA (2) GTGACTCATA TGCCACCCAC 13.8 0.0138 P8 GC+1d culture ATACTGAGAG CCCCACCCCA (2) CTCAACTTGT (3) GACCACAACA (2) GGAGGTGGAG (2) 42.1 0.0421 P8 GC+SHH+1d culture ATACTGAGAG ATGATACATA CCCCACCCCA (2) CTCAACTTGT (3) GAATAAAGAA GGAGGTGGAG (2) 41.1 0.0411 3T3 fibroblasts CCCCACCCCA (2) GGAGGTGGAG (2) 17.5 0.0175 E15 cortex CCCCACCCCA (2) GACCACAACA (2) GGAGGTGGAG (2) 24.6 0.0246 Hypothalamus CCCCACCCCA (2) CTGGAGCTGA (2) GGAGGTGGAG (2) TAGCCCAGGT (3) TGCCACCCAC 12.6 0.0126 E12.5 retina ATGATACATA CCCCACCCCA (2) CTGGAGCTGA (2) 18.8 0.0188 E14.5 retina ATGATACATA ATGCTGGAGA (2) CCCCACCCCA (2) CTCAACTTGT (3) GGAGGTGGAG (2) TAGCCCAGGT (3) 30.8 0.0308 E16.5 retina AGATCCGGCT CCCCACCCCA (2) CTCAACTTGT (3) GAATAAAGAA GAGCTCACAA GGAGGTGGAG (2) 16.2 0.0162 E18.5 retina ATGATACATA CCCCACCCCA (2) CTCAACTTGT (3) GAATAAAGAA GGAGGTGGAG (2) GTGACTCATA 16.2 0.0162 P0.5 retina ATACTGAGAG ATGATACATA CCCCACCCCA (2) GACCACAACA (2) GGAGGTGGAG (2) TAGCCCAGGA (2) 19.8 0.0198 P2.5 retina AGATCCGGCT CCCCACCCCA (2) CTCAACTTGT (3) GGAGGTGGAG (2) 10.6 0.0106 P4.5 retina ATGATACATA CCCCACCCCA (2) GAATAAAGAA GGAGGTGGAG (2) 17.8 0.0178 P6.5 retina ATGATACATA GAATAAAGAA GGAGGTGGAG (2) TAGCCCAGGT (3) 10 0.01 P10.5 crx- retina ATGCTGGAGA (2) CTGGAGCTGA (2) GGAGGTGGAG (2) 11.2 0.0112 P10.5 crx+ retina ATGATACATA CCCCACCCCA (2) GAGCATTCCT GAGCTCACAA GGAGGTGGAG (2) 17.2 0.0172 Adult retinal AGATCCGGCT ATGATACATA CCCCACCCCA (2) GAGCATTCCT GGAGGTGGAG (2) TAGCCCAGGT (3) TGCCACCCAC 18.8 0.0188 ONL ATGATACATA ATGCTGGAGA (2) GAGCATTCCT GGAGGTGGAG (2) GTGACTCATA TAGCCCAGGA (2) TAGCCCAGGT (3) 17.1 0.0171