Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.27670	Txnl5	thioredoxin-like 5	11	11 38.0 cM	52700
Gene Ontology	electron transport | electron transporter activity
Human Homolog	TXNL5[thioredoxin-like 5]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 76 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CTTTTAATCC (2) 60.4 0.0604 Cb medulloblastoma CCTTTAATCC (3) 41.6 0.0416 P8 GC+1d culture CCTTTAATCC (3) CCTTTACTCC CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CCTTTGGTCC CTTTTAATCC (2) 53.6 0.0536 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CCTTTGGTCC CTTTTAATCC (2) 34 0.034 3T3 fibroblasts CCTTTAATCC (3) 70.1 0.0701 E15 cortex CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) 64.3 0.0643 P1 cortex CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CCTTTGGTCC CTTTTAATCC (2) 218.1 0.2181 Hypothalamus CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) 23.5 0.0235 E12.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTACTCC CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CTTTTAATCC (2) 93.8 0.0938 E14.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CCTTTGGTCC CTTTTAATCC (2) 151.3 0.1513 E16.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTACTCC CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CCTTTGGTCC CTTTTAATCC (2) 88.6 0.0886 E18.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) 36.4 0.0364 P0.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTACTCC CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) 84.5 0.0845 P2.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CCTTTGGTCC 84.5 0.0845 P4.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTACTCC CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) 57.5 0.0575 P6.5 retina CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) 78.3 0.0783 P10.5 crx- retina CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CTTTTAATCC (2) 72.5 0.0725 P10.5 crx+ retina CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) 51.9 0.0519 Adult retinal CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CTTTTAATCC (2) 138.9 0.1389 ONL CCTTTAATCC (3) CCTTTAGTCC (2) CCTTTATTCC (3) CCTTTGGTCC CTTTTAATCC (2) 101.5 0.1015