Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.277599	Stub1	STIP1 homology and U-Box containing protein 1	17	17 11.6 cM	56424
Mm.277599	2310040B03Rik	RIKEN cDNA 2310040B03 gene	17		69636
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 113 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GGGTCAAAGG GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) TCCTGCTGGC (2) 68.4 0.0684 Cb medulloblastoma AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCAGATATGG (3) GGGTCAAAGG GTCCAGCAAG TACCGGTTGT (3) 27.6 0.0276 P8 GC+1d culture ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCAGATATGG (3) GGGTCAAAGG GTTGTGGTGG (2) TACCGGTTGT (3) TCCTGCCTGG (4) 80.9 0.0809 P8 GC+SHH+1d culture ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCAGATATGG (3) GGGTCAAAGG TACCGGTTGT (3) 72.6 0.0726 3T3 fibroblasts GCCAAGTTGG (2) GGGTCAAAGG 17.5 0.0175 E15 cortex AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GGGTCAAAGG TCCTGCCTGG (4) 49.4 0.0494 P1 cortex GGGTCAAAGG TACCGGTTGT (3) 27.2 0.0272 Hypothalamus AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) GGGTCAAAGG TACCGGTTGT (3) 27.1 0.0271 E12.5 retina AGCCTCCCTT (3) GGGTCAAAGG GTCCAGCAAG GTTCTGGTGG (3) GTTGTGGTGG (2) TACCGGTTGT (3) 56.3 0.0563 E14.5 retina ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCTTACCTTG (3) GGGTCAAAGG GTCCAGCAAG 14.4 0.0144 E16.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GGGTCAAAGG TACCGGTTGT (3) TCCTGCTGGC (2) 47 0.047 E18.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GGGCAGTGCC GGGTCAAAGG GTTGTGGTGG (2) TACCGGTTGT (3) 56.4 0.0564 P0.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GGGTCAAAGG GTTCTGGTGG (3) TCCTGCCTGG (4) 62.9 0.0629 P2.5 retina AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) GCTTACCTTG (3) GGGTCAAAGG GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 68.8 0.0688 P4.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCCAAGTTGG (2) GGGTCAAAGG TACCGGTTGT (3) 51.6 0.0516 P6.5 retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCTTACCTTG (3) GGGCAGTGCC GGGTCAAAGG GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) TCCTGCTGGC (2) 41.7 0.0417 P10.5 crx- retina AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCTTACCTTG (3) GGGTCAAAGG GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 85.5 0.0855 P10.5 crx+ retina CCACCACCGA (2) GGGCAGTGCC GGGTCAAAGG GTCCAGCAAG GTTGTGGTGG (2) TACCGGTTGT (3) TCCTGCTGGC (2) 67.3 0.0673 Adult retinal AGCCTCCCTT (3) CCACCACCGA (2) GCCAAGTTGG (2) GGGCAGTGCC GGGTCAAAGG GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) TCCTGCTGGC (2) 57.7 0.0577 ONL ACCCTCGTGG (3) CCACCACCGA (2) GGGCAGTGCC GGGTCAAAGG GTTCTGGTGG (3) TACCGGTTGT (3) TCCTGCTGGC (2) 53.5 0.0535