Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.279844	2610003J06Rik	RIKEN cDNA 2610003J06 gene	17		72106
Human Homolog	LOC339123[similar to RIKEN cDNA 2610003J06]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 58 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGCCTCCCTT (3) GCGGCGGCTG (2) TACCGGTTGT (3) 9.7 0.0097 Cb medulloblastoma AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) GTCCAGCAAG TACCGGTTGT (3) 13.8 0.0138 P8 GC+1d culture ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) TACCGGTTGT (3) TCCTGCCTGG (4) 14.8 0.0148 P8 GC+SHH+1d culture ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) GCGGCGGCTG (2) TACCGGTTGT (3) 15.2 0.0152 3T3 fibroblasts GCCAAGTTGG (2) 3.5 0.0035 E15 cortex AGCCTCCCTT (3) TCCTGCCTGG (4) 14.8 0.0148 P1 cortex TACCGGTTGT (3) 4.5 0.0045 Hypothalamus AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) GCGGCGGCTG (2) TACCGGTTGT (3) 25.3 0.0253 E12.5 retina AGCCTCCCTT (3) GTCCAGCAAG TACCGGTTGT (3) 28.1 0.0281 E14.5 retina ACCCTCGTGG (3) AGCCTCCCTT (3) GTCCAGCAAG 7.2 0.0072 E16.5 retina AGCCTCCCTT (3) GCGGCGGCTG (2) TACCGGTTGT (3) 10.8 0.0108 E18.5 retina AGCCTCCCTT (3) TACCGGTTGT (3) 12.8 0.0128 P0.5 retina AGCCTCCCTT (3) GCGGCGGCTG (2) TCCTGCCTGG (4) 11.8 0.0118 P2.5 retina AGCCTCCCTT (3) GCAGATATGG (3) TACCGGTTGT (3) 24.7 0.0247 P4.5 retina AGCCTCCCTT (3) GCCAAGTTGG (2) TACCGGTTGT (3) 17.9 0.0179 P6.5 retina AGCCTCCCTT (3) TACCGGTTGT (3) 16.7 0.0167 P10.5 crx- retina AGCCTCCCTT (3) GCGGCGGCTG (2) TACCGGTTGT (3) 16.7 0.0167 P10.5 crx+ retina GTCCAGCAAG TACCGGTTGT (3) 7.7 0.0077 Adult retinal AGCCTCCCTT (3) GCCAAGTTGG (2) GCGGCGGCTG (2) TACCGGTTGT (3) 22.3 0.0223 ONL ACCCTCGTGG (3) TACCGGTTGT (3) 5.7 0.0057