| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CCCCTCCTGC (4) CCTCCTGCCC (3) TTGATGTTGA TTTATGTTGA
| 14.7 | 0.0147 |
| Cb medulloblastoma | CAAAAATAAG CCTCCACCCA TTGATGTTGA
| 9.2 | 0.0092 |
| P8 GC+1d culture | CAAAAATAAG CCTCCTGCCC (3) TTGATGTTGA
| 19.3 | 0.0193 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CTTTTCATTA (2) TGGTGCACAG (2) TTGATGTTGA TTTATGTTGA
| 26.9 | 0.0269 |
| 3T3 fibroblasts | CCTCCACCCA TGGTGCACAG (2) TTGATGTTGA
| 14 | 0.014 |
| E15 cortex | CCTCCTGCCC (3)
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | CCCCTCCTGC (4) TTGATGTTGA
| 9 | 0.009 |
| Hypothalamus | CAAAAATAAG CCTCCTGCCC (3) TGGTGCACAG (2) TTGATGTTGA TTTATGTTGA
| 27.1 | 0.0271 |
| E12.5 retina | CCTCCTGCCC (3) CTTTTCATTA (2) TTGATGTTGA
| 30.1 | 0.0301 |
| E14.5 retina | CAAAAATAAG TGGTGCACAG (2) TTGATGTTGA
| 25.5 | 0.0255 |
| E16.5 retina | CCCCTCCTGC (4) TTGATGTTGA TTTATGTTGA
| 25.3 | 0.0253 |
| E18.5 retina | TGGTGCACAG (2) TTGATGTTGA TTTATGTTGA
| 20 | 0.02 |
| P0.5 retina | CCTCCACCCA CCTCCTGCCC (3) TTGATGTTGA
| 7.9 | 0.0079 |
| P2.5 retina | CAAAAATAAG TGGTGCACAG (2) TTGATGTTGA
| 14.2 | 0.0142 |
| P4.5 retina | CAAAAATAAG CTTTTCATTA (2) TTGATGTTGA TTTATGTTGA
| 15.9 | 0.0159 |
| P6.5 retina | CCTCCACCCA TTGATGTTGA
| 11.7 | 0.0117 |
| P10.5 crx- retina | CTTTTCATTA (2) TTGATGTTGA TTTATGTTGA
| 20.5 | 0.0205 |
| P10.5 crx+ retina | CCTCCTGCCC (3) TTGATGTTGA
| 7.7 | 0.0077 |
| Adult retinal | CCTCCACCCA TTGATGTTGA
| 7.4 | 0.0074 |
| ONL | CCTCCACCCA TGGTGCACAG (2) TTGATGTTGA TTTATGTTGA
| 11.4 | 0.0114 |