Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.2845 Ubtfupstream binding transcription factor, RNA polymerase I 11    21429 
 Gene Ontology DNA binding | nucleolus | nucleus | protein binding | regulation of transcription, DNA-dependent | transcription factor activity | transcription factor complex
 Human Homolog UBTF[upstream binding transcription factor, RNA polymerase I]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 102 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GACAATGGAC
GAGAAGAAGG (2)
GAGAAGGGGG (2)
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
65.30.0653
Cb medulloblastomaAAGGATGTGC (2)
ACCAAGCTCC
CAGCCTCCTA
GAGAAGAAGG (2)
GATGAAGACT (2)
GTGCTATGCA (2)
GTGGAGATTG (2)
62.30.0623
P8 GC+1d cultureAAGGATGTGC (2)
ACCAAGCTCC
CAGCCTCCTA
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
GTGCTATGCA (2)
GTGGAGATTG (2)
61.60.0616
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GACAATGGAC
GAGAAGAAGG (2)
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
TCTATCCCCC
50.40.0504
3T3 fibroblastsAAGGATGTGC (2)
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
420.042
E15 cortexAAGGATGTGC (2)
GATGAAGACT (2)
GTGCTATGCA (2)
GTGGAGATTG (2)
64.30.0643
P1 cortexAAGGATGTGC (2)
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
180.018
HypothalamusAAGGATGTGC (2)
GACAATGGAC
GAGAAGGGGG (2)
GTGGAGATTG (2)
19.90.0199
E12.5 retinaAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
56.50.0565
E14.5 retinaAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GATGAAGACT (2)
GCTATCCAGG
GTGGAGATTG (2)
34.60.0346
E16.5 retinaAAGGATGTGC (2)
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
45.30.0453
E18.5 retinaAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
23.70.0237
P0.5 retinaAAGGATGTGC (2)
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
GCTATCCAGG
GTGGAGATTG (2)
47.20.0472
P2.5 retinaAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GACAATGGAC
GAGAAGGGGG (2)
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
38.70.0387
P4.5 retinaAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GAGAAGGGGG (2)
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
25.80.0258
P6.5 retinaAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GACAATGGAC
GAGAAGGGGG (2)
GATGAAGACT (2)
GCTATCCAGG
GTGCTATGCA (2)
GTGGAGATTG (2)
46.80.0468
P10.5 crx- retinaAAGGATGTGC (2)
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
83.60.0836
P10.5 crx+ retinaAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
42.30.0423
Adult retinalAAGGATGTGC (2)
GACAATGGAC
GATGAAGACT (2)
GTGGAGATTG (2)
520.052
ONLAAGGATGTGC (2)
CAGCCTCCTA
GAGAAGAAGG (2)
GATGAAGACT (2)
19.20.0192