Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.28721 Brd3bromodomain containing 3 2    67382 
 Mm.28721 D2Bwg1423eDNA segment, Chr 2, Brigham & Women's Genetics 1423 expressed 2  2 20.0 cM  329372 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 175 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACCTTTCTC (2)
ACTTTTCTCT (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
ATTACCAGAG (2)
GAGGCGCCTG (2)
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
GTGACAAAAA (3)
TCACCTTCTG (2)
42.40.0424
Cb medulloblastomaACAGCTGCAG (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
GTGACAAAAA (3)
TCACCTTCTG (2)
TCTTAAAAAC (3)
85.40.0854
P8 GC+1d cultureAACCTTTCTC (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
CAAGTTTACC (2)
GAGGCGCCTG (2)
GCCACCACTT (3)
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
TCACCTTCTG (2)
TCTTTCTGCC
TGACCTCTAG (3)
TGTAGAGTGA (2)
52.30.0523
P8 GC+SHH+1d cultureAACCTTTCTC (2)
ACAGCTGCAG (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
CAAGTTTACC (2)
GCCACCACTT (3)
GCCAGGAAGC (3)
GGAACCAGCC (2)
GGCAGGCCCT (2)
GTGAAAAAAA (2)
GTGACAAAAA (3)
TCACCTTCTG (2)
TCTTTCTGCC
TGACCTCTAG (3)
47.90.0479
3T3 fibroblastsGGAACCAGCC (2)
140.014
E15 cortexAACCTTTCTC (2)
ACTTTTCTCT (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCTATGATG (2)
CAAGTTTACC (2)
GACCTCAGCA (2)
GAGGCGCCTG (2)
GCCAGGAAGC (3)
GGAACCAGCC (2)
GGCAGGCCCT (2)
TCTTTCTGCC
TGACCTCTAG (3)
123.40.1234
P1 cortexAACCTTTCTC (2)
ACTTTTCTCT (2)
CAAGTTTACC (2)
GAGGCGCCTG (2)
GGAACCAGCC (2)
TCACCTTCTG (2)
TCTTTCTGCC
63.50.0635
HypothalamusAGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
CAAGTTTACC (2)
GACCTCAGCA (2)
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
TCACCTTCTG (2)
380.038
E12.5 retinaAACCTTTCTC (2)
ACAGCTGCAG (2)
ACTTTTCTCT (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
AGCTATGATG (2)
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
GTGACAAAAA (3)
TCACCTTCTG (2)
TCTTAAAAAC (3)
TGTAGAGTGA (2)
52.80.0528
E14.5 retinaAACCTTTCTC (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
GAGGCGCCTG (2)
GCCACCACTT (3)
GCCAGGAAGC (3)
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
GTGACAAAAA (3)
TCACCTTCTG (2)
49.20.0492
E16.5 retinaAACCTTTCTC (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
GAGGCGCCTG (2)
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
TCACCTTCTG (2)
TCTTAAAAAC (3)
41.50.0415
E18.5 retinaAACCTTTCTC (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
GGAACCAGCC (2)
GGCAGGCCCT (2)
GTGAAAAAAA (2)
TCACCTTCTG (2)
47.20.0472
P0.5 retinaAACCTTTCTC (2)
ACAGCTGCAG (2)
ACTTTTCTCT (2)
AGCCTATGAT
GAGGCGCCTG (2)
GGAACCAGCC (2)
GGGGGGCGGG
GTGAAAAAAA (2)
TCACCTTCTG (2)
TGACCTCTAG (3)
35.60.0356
P2.5 retinaAACCTTTCTC (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
GAGGCGCCTG (2)
GGAACCAGCC (2)
GGCAGGCCCT (2)
GTGAAAAAAA (2)
GTGACAAAAA (3)
TCACCTTCTG (2)
TCTTTCTGCC
TGACCTCTAG (3)
44.20.0442
P4.5 retinaAACCTTTCTC (2)
ACAGCTGCAG (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
CAAGTTTACC (2)
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
GTGACAAAAA (3)
TGACCTCTAG (3)
53.50.0535
P6.5 retinaAACCTTTCTC (2)
ACTTTTCTCT (2)
AGAAGAAAAT (3)
ATTACCAGAG (2)
GGAACCAGCC (2)
GGGGGGCGGG
GTGAAAAAAA (2)
TCACCTTCTG (2)
30.20.0302
P10.5 crx- retinaAGCCTATGAT
GAGGCGCCTG (2)
GTGAAAAAAA (2)
TCACCTTCTG (2)
TGACCTCTAG (3)
22.30.0223
P10.5 crx+ retinaAACCTTTCTC (2)
AGCCTATGAT
GGAACCAGCC (2)
GGGGGGCGGG
GTGAAAAAAA (2)
GTGACAAAAA (3)
TCACCTTCTG (2)
32.50.0325
Adult retinalAACCTTTCTC (2)
ACAGCTGCAG (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
TCACCTTCTG (2)
TCTTTCTGCC
TGACCTCTAG (3)
24.40.0244
ONLAACCTTTCTC (2)
AGAAGAAAAT (3)
AGCCTATGAT
ATTACCAGAG (2)
GGAACCAGCC (2)
GTGAAAAAAA (2)
TCTTAAAAAC (3)
TGTAGAGTGA (2)
24.70.0247