Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.288645 2500001H09RikRIKEN cDNA 2500001H09 gene 7    74737 
 Mm.288645 6430511E19RikRIKEN cDNA 6430511E19 gene 7    320056 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 96 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TGATTTCTTT (3)
TTACCCATCT (2)
TTATAAACTG (2)
TTTTAAAACA
34.30.0343
Cb medulloblastomaGCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TGATTTCTTT (3)
TTATAAACTG (2)
TTTATTTTAA (2)
TTTTAAAACA
34.60.0346
P8 GC+1d cultureATATTTGTAG (3)
GAGCCTATTT (2)
GCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TGATTTCTTT (3)
TTTATTTTAA (2)
40.90.0409
P8 GC+SHH+1d cultureATATTTGTAG (3)
GCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TGATTTCTTT (3)
TTATAAACTG (2)
30.50.0305
3T3 fibroblastsGCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
210.021
E15 cortexCACCTCCACT
GCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
59.30.0593
P1 cortexGTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TTATAAACTG (2)
27.20.0272
HypothalamusCACCTCCACT
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TTATAAACTG (2)
TTTATTTTAA (2)
43.40.0434
E12.5 retinaGCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TTATAAACTG (2)
35.70.0357
E14.5 retinaGCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TTATAAACTG (2)
40.10.0401
E16.5 retinaGCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TTATAAACTG (2)
54.30.0543
E18.5 retinaATGGTTTTTT (2)
GAGCCTATTT (2)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TTATAAACTG (2)
32.70.0327
P0.5 retinaGCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
39.30.0393
P2.5 retinaGCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
440.044
P4.5 retinaGCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TTACCCATCT (2)
TTATAAACTG (2)
47.60.0476
P6.5 retinaGCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TTATAAACTG (2)
TTTATTTTAA (2)
35.10.0351
P10.5 crx- retinaGCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TGATTTCTTT (3)
TTATAAACTG (2)
27.90.0279
P10.5 crx+ retinaCACCTCCACT
GCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TAATAAACTG (2)
TTATAAACTG (2)
38.30.0383
Adult retinalGCAAAGAGCA (5)
GCCAGCCAGG (2)
GTAGCTCACA (3)
TTACCCATCT (2)
TTATAAACTG (2)
26.10.0261
ONLATGGTTTTTT (2)
GTAGCTCACA (3)
TTATAAACTG (2)
30.60.0306