| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | AAAGCACAGC CAACTATGGT TTATCAAGTG
| 9.8 | 0.0098 |
| Cb medulloblastoma | CAACTATGGT CCTAACTTGC TGACTCCTTG
| 11.5 | 0.0115 |
| P8 GC+1d culture | CAACTATGGT TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 12.5 | 0.0125 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AAAGCACAGC CAACTATGGT GATATTTAAA (2) GTTTTAATTC (4) TGACTCCTTG
| 21 | 0.021 |
| 3T3 fibroblasts | TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 24.5 | 0.0245 |
| E15 cortex | TTATCAAGTG
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | TTATCAAGTG
| 13.6 | 0.0136 |
| Hypothalamus | CAACTATGGT CCTGCCTGCT (4) TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 10.8 | 0.0108 |
| E12.5 retina | CAACTATGGT TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 15 | 0.015 |
| E14.5 retina | CAACTATGGT TTATCAAGTG
| 9.1 | 0.0091 |
| E16.5 retina | AGACAAAATA CAACTATGGT GATATTTAAA (2) TTATCAAGTG
| 12.6 | 0.0126 |
| E18.5 retina | AAAGCACAGC CAACTATGGT CCTGCCTGCT (4) GATATTTAAA (2)
| 14.6 | 0.0146 |
| P0.5 retina | CAACTATGGT TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 19.7 | 0.0197 |
| P2.5 retina | CAACTATGGT GATATTTAAA (2) GTTTTAATTC (4) TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 17.7 | 0.0177 |
| P4.5 retina | CAACTATGGT CCTAACTTGC CCTGCCTGCT (4) GATATTTAAA (2) TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 19.9 | 0.0199 |
| P6.5 retina | AGACAAAATA CAACTATGGT TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 18.4 | 0.0184 |
| P10.5 crx- retina | AGACAAAATA CAACTATGGT GATATTTAAA (2) GTTTTAATTC (4) TGACTCCTTG
| 22.4 | 0.0224 |
| P10.5 crx+ retina | AGACAAAATA CAACTATGGT TTATCAAGTG
| 7.6 | 0.0076 |
| Adult retinal | CAACTATGGT GATATTTAAA (2) TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 15 | 0.015 |
| ONL | CAACTATGGT GATATTTAAA (2) TGACTCCTTG TTATCAAGTG
| 13.4 | 0.0134 |