Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.288894	Eps15-rs	epidermal growth factor receptor pathway substrate 15, related sequence	8		13859
Gene Ontology	calcium ion binding | coated pit | endocytosis | nucleus
Human Homolog	EPS15L1[epidermal growth factor receptor pathway substrate 15-like 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 117 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GGTTACAAGA TGGTTGCTGG 295.2 0.2952 Cb medulloblastoma ATGTATGCAT (3) CCACCAAAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) TGGTTGCTGG 709.8 0.7098 P8 GC+1d culture AGGTCCTGGA (3) ATGTATGCAT (3) CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GTTATTTTTG TGGTTGCTGG 326.4 0.3264 P8 GC+SHH+1d culture AGGTCCTGGA (3) ATGTATGCAT (3) CCAAAACAAA CCACCAAAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) TGGTTGCTGG 367.7 0.3677 3T3 fibroblasts AGGTCCTGGA (3) CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GGTTACAAGA TGGTTGCTGG 318.9 0.3189 E15 cortex ATGTATGCAT (3) CCACAGCCAA (2) CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) TGGTTGCTGG TGTGTGGGGT 494.6 0.4946 P1 cortex CCAAAACAAA GCACAACTTG (2) GTTATTTTTG TGGTTGCTGG 186.3 0.1863 Hypothalamus AGGTCCTGGA (3) ATGTATGCAT (3) CCACCAAAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) TGGTTGCTGG 594 0.594 E12.5 retina ATGTATGCAT (3) CCACAGCCAA (2) CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) TGGTTGCTGG 268.5 0.2685 E14.5 retina ATGTATGCAT (3) CCAAAACAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GTTATTTTTG TCGCATTGGG TGGTTGCTGG TGTGTGGGGT 1100.4 1.1004 E16.5 retina ATGTATGCAT (3) GCACAACTTG (2) GTTATTTTTG TGGTTGCTGG 941.8 0.9418 E18.5 retina ATGTATGCAT (3) CCACCAAAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GTTATTTTTG TGGTTGCTGG 507.3 0.5073 P0.5 retina AGGTCCTGGA (3) ATGTATGCAT (3) CCAAAACAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) TGGTTGCTGG 425.9 0.4259 P2.5 retina ATGTATGCAT (3) CCAAAACAAA CCACAGCCAA (2) CCACCAAAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GGTTACAAGA GTTATTTTTG TGGTTGCTGG 357.4 0.3574 P4.5 retina ATGTATGCAT (3) CCACAGCCAA (2) CCACCAAAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GTTATTTTTG TGGTTGCTGG 358.8 0.3588 P6.5 retina ATGTATGCAT (3) CCACCAAAAA CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GGTTACAAGA TGGTTGCTGG 328.5 0.3285 P10.5 crx- retina ATGTATGCAT (3) CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) TGGTTGCTGG 499.7 0.4997 P10.5 crx+ retina ATGTATGCAT (3) CCAAAACAAA CCACAGCCAA (2) CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GTTATTTTTG TGGTTGCTGG 415.3 0.4153 Adult retinal AGGTCCTGGA (3) ATGTATGCAT (3) CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) GTTATTTTTG TGGTTGCTGG TGTGTGGGGT 331.6 0.3316 ONL ATGTATGCAT (3) CCCTGCCCTG (4) GCACAACTTG (2) TGGTTGCTGG TGTGTGGGGT 451.9 0.4519