Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.290407 Nap1l1nucleosome assembly protein 1-like 1 10  10 60.0 cM  53605 
 Mm.290407 D10Ertd284eDNA segment, Chr 10, ERATO Doi 284, expressed 10  10 60.0 cM  52558 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 101 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGTTGCATT (4)
AGAGCTAAAA (2)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
TTTTCATTTT (3)
24.50.0245
Cb medulloblastomaAAGTTGCATT (4)
GGAAAAAAAA (2)
GGATGCTGTC (4)
TTTAGGCTAT (2)
50.80.0508
P8 GC+1d cultureAAGTTGCATT (4)
AGAGCTAAAA (2)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
TTTTCATTTT (3)
250.025
P8 GC+SHH+1d cultureAAGTTGCATT (4)
ACTCATTTAC (2)
AGAGCTAAAA (2)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGATGCTGTC (4)
TTGTTAGAGG (3)
TTTTCATTTT (3)
38.60.0386
3T3 fibroblastsATCTCGAGAG (3)
TTGTTAGAGG (3)
490.049
E15 cortexATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
GGATGCTGTC (4)
TTGTTAGAGG (3)
29.50.0295
P1 cortexATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
TTTTCATTTT (3)
31.70.0317
HypothalamusAAGTTGCATT (4)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
18.10.0181
E12.5 retinaAAGTTGCATT (4)
AGAGCTAAAA (2)
ATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
24.60.0246
E14.5 retinaACTCATTTAC (2)
AGAGCTAAAA (2)
GACACACACA
GGAAAAAAAA (2)
18.10.0181
E16.5 retinaATCTCGAGAG (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTCATTTATT (3)
TTGTTAGAGG (3)
12.60.0126
E18.5 retinaAAGTTGCATT (4)
ACTCATTTAC (2)
AGAGCTAAAA (2)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTCATTTATT (3)
TTGTTAGAGG (3)
32.70.0327
P0.5 retinaAAGTTGCATT (4)
AGAGCTAAAA (2)
ATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
TTTAGGCTAT (2)
51.10.0511
P2.5 retinaAAGTTGCATT (4)
AGAGCTAAAA (2)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTCATTTATT (3)
TTGTTAGAGG (3)
TTTTCATTTT (3)
19.50.0195
P4.5 retinaAAGTTGCATT (4)
AGAGCTAAAA (2)
GGAAAAAAAA (2)
TTCATTTATT (3)
TTGTTAGAGG (3)
25.80.0258
P6.5 retinaAAGTTGCATT (4)
ACTCATTTAC (2)
ATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
350.035
P10.5 crx- retinaAAGTTGCATT (4)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
130.013
P10.5 crx+ retinaAAGTTGCATT (4)
ATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
26.90.0269
Adult retinalAAGTTGCATT (4)
ATGAACCTAT (3)
GGAAAAAAAA (2)
TTGTTAGAGG (3)
11.30.0113
ONLAAGTTGCATT (4)
ATGAACCTAT (3)
GACACACACA
GGAAAAAAAA (2)
TTCATTTATT (3)
32.40.0324