Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.29344	Tde2	tumor differentially expressed 2	10		56442
Gene Ontology	integral to membrane | membrane | plasma membrane
Human Homolog	TDE2[tumor differentially expressed 2]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 160 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) AGGCCAGGAG ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTCTGGC CTCTTTCTTG CTGGACCAGC GCGATGTTAA GCGGGCGCCT TTCCAGCCTT (2) TTCCATCCTT (3) 329.3 0.3293 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTCTGGC CTGGACAGCA (2) GCGATGTTAA GCGGGCGCCT TTCCACCCTT TTCCAGCCTT (2) TTCCATCCTT (3) TTCTTGCTAA 1068.3 1.0683 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) AGTCCACTTT (2) ATTAAATATG (2) ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG CTGGACAGCA (2) TGGGATAAAA TGTCTTTAAA (2) TTCCAGCCTT (2) TTCCATCCTT (3) TTCTTGCTAA 355.9 0.3559 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) AGGCCAGGAG AGTCCACTTT (2) ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG TTCCACCCTT TTCCAGCCTT (2) TTTGGATAAA 419.3 0.4193 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) AGTCCACTTT (2) ATTTGACTGG (2) CTGGACAGCA (2) CTGGACCAGC GTCTGCTATG (2) TTCCAGCCTT (2) 101.6 0.1016 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG CTGGACCAGC TTCCAGCCTT (2) TTCTTGCTAA 306.6 0.3066 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG TTCCAGCCTT (2) 331.7 0.3317 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) ATTAAATATG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG CTGGACAGCA (2) GCGATGTTAA GCGGGCGCCT TTCCAGCCTT (2) TTTCTTGCTA 298.8 0.2988 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGCCAGGAG CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG CTGGACCAGC TTCCAGCCTT (2) TTCTTGCTAA 195.3 0.1953 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATTCATAA AGGCCAGGAG ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG CTGGACAGCA (2) TGTCTTTAAA (2) TTCCAGCCTT (2) 162 0.162 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTCTGGC CTCTTTCTTG CTGGACAGCA (2) TTCCAGCCTT (2) 112.3 0.1123 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTCTGGC CTCTTTCTTG GTCTGCTATG (2) TTCCAGCCTT (2) TTCCATCCTT (3) TTTCTTGCTA 480 0.48 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG GTCTGCTATG (2) TTCCAGCCTT (2) TTTCTTGCTA 294.5 0.2945 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) ATTAAATATG (2) ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG GCGGGCGCCT GTCTGCTATG (2) TGTCTTTAAA (2) TTCCAGCCTT (2) TTCTTGCTAA 480.7 0.4807 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGGCCAGGAG CAAAAAAAAA (2) CTCTTCTGGC CTCTTTCTTG TGGGATAAAA TGTCTTTAAA (2) TTCCAGCCTT (2) TTCCATCCTT (3) 422.1 0.4221 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG TGGGATAAAA TTCCAGCCTT (2) TTCCATCCTT (3) 407 0.407 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) AGGCCAGGAG ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG TTCCAGCCTT (2) TTCCATCCTT (3) TTTCTTGCTA 198.9 0.1989 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) ATTTGACTGG (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG TTCCAGCCTT (2) TTCCATCCTT (3) TTCTTGCTAA TTTGGATAAA 247.8 0.2478 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG TTCCACCCTT TTCCAGCCTT (2) 161.2 0.1612 ONL AAAAAAAAAA (2) AAATTCATAA AGGCCAGGAG CAAAAAAAAA (2) CTCTTTCTTG TTCCAGCCTT (2) TTCTTGCTAA 158.8 0.1588