Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.293605	Trp53inp2	tumor protein p53 inducible nuclear protein 2	2		68728
Gene Ontology	nucleus
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 92 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATCTTGCTGC (3) CCTGTGTATG CTTCAGGAAT GCCTGTGTAT (2) TTGGGATGTT (3) 22.9 0.0229 Cb medulloblastoma CACCCCAGGA CCTGTGTATG GCCTGTGTAT (2) GGGACAGAGG (2) TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 25.3 0.0253 P8 GC+1d culture CACCCCAGGA CCTGTGTATG GCCTGTGTAT (2) GTCAGTCAAA TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 42.3 0.0423 P8 GC+SHH+1d culture ACCAGGTCGA (2) ATCTTGCTGC (3) CCTGTGTATG CTTCAGGAAT GCCTGTGTAT (2) GTCAGTCAAA TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 24.8 0.0248 3T3 fibroblasts CCTGTGTATG 3.5 0.0035 E15 cortex TTGGGATGTT (3) 9.9 0.0099 P1 cortex GTCAGTCAAA TTGGGATGTT (3) 27.2 0.0272 Hypothalamus CACCCCAGGA CCTGTGTATG GCCTGTGTAT (2) GGGACAGAGG (2) GTCAGTCAAA TGGATGCTGT TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 47 0.047 E12.5 retina ATCTTGCTGC (3) CCTGTGTATG GCCTGTGTAT (2) TTGGGATGTG 18.8 0.0188 E14.5 retina ATCTTGCTGC (3) GGGACAGAGG (2) TGGATGCTGT TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 19.9 0.0199 E16.5 retina CACCCCAGGA CCTGTGTATG GTCAGTCAAA TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 14.4 0.0144 E18.5 retina ACCAGGTCGA (2) TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 9.1 0.0091 P0.5 retina CCTGTGTATG GGGACAGAGG (2) TTGGGATGTG 9.8 0.0098 P2.5 retina CACCCCAGGA CCTGTGTATG GCCTGTGTAT (2) GTCAGTCAAA TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 31.8 0.0318 P4.5 retina CCTGTGTATG TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 17.9 0.0179 P6.5 retina CCTGTGTATG GGGACAGAGG (2) GTCAGTCAAA TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 33.4 0.0334 P10.5 crx- retina CACCCCAGGA CCTGTGTATG GCCTGTGTAT (2) GGGACAGAGG (2) TTGGGATGTG TTGGGATGTT (3) 33.4 0.0334 P10.5 crx+ retina CCTGTGTATG GCCTGTGTAT (2) GGGACAGAGG (2) GTCAGTCAAA TTGGGATGTT (3) 284.4 0.2844 Adult retinal CCTGTGTATG CTTCAGGAAT GGGACAGAGG (2) GTCAGTCAAA TTGGGATGTT (3) 524.1 0.5241 ONL CCTGTGTATG GCCTGTGTAT (2) GGGACAGAGG (2) GTCAGTCAAA TTGGGATGTT (3) 894.4 0.8944