| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | AGACTCAATT CCTTTAATCC (3) TACCGGCTCC (2)
| 55.4 | 0.0554 |
| Cb medulloblastoma | AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3)
| 46.2 | 0.0462 |
| P8 GC+1d culture | AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3) TACCGGCTCC (2)
| 40 | 0.04 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3)
| 27 | 0.027 |
| 3T3 fibroblasts | CCTTTAATCC (3)
| 70.1 | 0.0701 |
| E15 cortex | CCTTTAATCC (3)
| 54.4 | 0.0544 |
| P1 cortex | AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3)
| 159 | 0.159 |
| Hypothalamus | AATTAGAGAA AGACTCAATT CCTTTAATCC (3)
| 25.3 | 0.0253 |
| E12.5 retina | AATTAGAGAA AGACTCAATT CCTTTAATCC (3)
| 90.1 | 0.0901 |
| E14.5 retina | AGACTCAATT CCTTTAATCC (3)
| 122.1 | 0.1221 |
| E16.5 retina | AAACTGTGTG AATTAGAGAA AGACTCAATT CCTTTAATCC (3)
| 77.8 | 0.0778 |
| E18.5 retina | AATTAGAGAA AGACTCAATT CCTTTAATCC (3) TACCGGCTCC (2)
| 36.3 | 0.0363 |
| P0.5 retina | AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3)
| 76.5 | 0.0765 |
| P2.5 retina | AATTAGAGAA AGACTCAATT CCTTTAATCC (3)
| 77.4 | 0.0774 |
| P4.5 retina | AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3)
| 45.6 | 0.0456 |
| P6.5 retina | AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3)
| 75 | 0.075 |
| P10.5 crx- retina | AAACTGTGTG AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3)
| 68.8 | 0.0688 |
| P10.5 crx+ retina | CCTTTAATCC (3)
| 38.4 | 0.0384 |
| Adult retinal | CCTTTAATCC (3)
| 129.6 | 0.1296 |
| ONL | AATTAGAGAA CCTTTAATCC (3)
| 86.2 | 0.0862 |