Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.295397 Depdc6DEP domain containing 6 15  15 6.7 cM  97998 
 Gene Ontology intracellular signaling cascade
 Human Homolog DEPDC6[DEP domain containing 6]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 102 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAATAAATGT (3)
CCTCACTGGT (2)
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
TGAGCCCCTG
TTGGTAATTT
29.40.0294
Cb medulloblastomaAAATAAATGT (3)
CCTCACTGGT (2)
CCTGTCTCCC (2)
TAGCCCAGGC (2)
TGTCTAACAA
20.70.0207
P8 GC+1d cultureAAATAAATGT (3)
CAGCTAATTA
CCTCACTGGT (2)
CCTGTCTCCC (2)
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
TGAGCCCCTG
TGTCTAACAA
26.10.0261
P8 GC+SHH+1d cultureAAATAAATGT (3)
CCTCACTGGT (2)
CCTGTCTCCC (2)
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
TGAGCCCCTG
TGTCTAACAA
23.40.0234
3T3 fibroblastsCCTCACTGGT (2)
CCTGTCTCCC (2)
TAGCCCAGGC (2)
TGAGCCCCTG
38.50.0385
E15 cortexCCTCACTGGT (2)
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
39.50.0395
P1 cortexCCTCACTGGT (2)
9.10.0091
HypothalamusAAATAAATGT (3)
CAGCTAATTA
CCTCACTGGT (2)
TAGCCCAGGC (2)
TGAGCCCCTG
TGTCTAACAA
TTGGTAATTT
41.50.0415
E12.5 retinaAAATAAATGT (3)
CCACATCCAG
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
TGAGCCCCTG
22.60.0226
E14.5 retinaAAATAAATGT (3)
CACACCACAC
CCTCACTGGT (2)
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
TGAGCCCCTG
TTGGTAATTT
310.031
E16.5 retinaAAATAAATGT (3)
CCTCACTGGT (2)
TAGCCCAGGC (2)
TTGGTAATTT
27.10.0271
E18.5 retinaAAATAAATGT (3)
CCACATCCAG
CCTCACTGGT (2)
TAGCCCAGGC (2)
TTGGTAATTT
25.40.0254
P0.5 retinaCCTCACTGGT (2)
TAGCCCAGGC (2)
11.80.0118
P2.5 retinaAAATAAATGT (3)
CACACCACAC
CCTCACTGGT (2)
CCTGTCTCCC (2)
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
TGAGCCCCTG
TTGGTAATTT
24.80.0248
P4.5 retinaAAATAAATGT (3)
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
TTGGTAATTT
100.01
P6.5 retinaAAATAAATGT (3)
CACACCACAC
CCTGTCTCCC (2)
TAGCCCAGGC (2)
16.70.0167
P10.5 crx- retinaAAATAAATGT (3)
CCACATCCAG
CCTCACTGGT (2)
CCTGTCTCCC (2)
TAGCCCAGGC (2)
TGAGCCCCTG
26.10.0261
P10.5 crx+ retinaAAATAAATGT (3)
CAGCTAATTA
CCTCACTGGT (2)
TAGCCCAGGC (2)
TGAGCCCCTG
210.021
Adult retinalAAATAAATGT (3)
CCACATCCAG
CCTCACTGGT (2)
CCTGTCTCCC (2)
TAGCCCAGGC (2)
TCTCGAAAAA
18.70.0187
ONLAAATAAATGT (3)
CCACATCCAG
TAGCCCAGGC (2)
TGAGCCCCTG
TTGGTAATTT
19.10.0191