Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.296985 2610204B21RikRIKEN cDNA 2610204B21 gene 11    67165 
 Mm.296985 Cct4chaperonin subunit 4 (delta) 11  11 13.0 cM  12464 
 Gene Ontology ATP binding | protein folding
 Human Homolog CCT4[chaperonin containing TCP1, subunit 4 (delta)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 118 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGGTCTCTG
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGAGAA (2)
CCCAAGGAGA (3)
GAATTCAAAG
GCGGTTTTTT (2)
GGAAGAGGGA (2)
19.50.0195
Cb medulloblastomaAAGGTCTCTG
ATTGTAAATT (2)
CAGTACTCTT (2)
CCCCAGGAGA
GAAATTTATA
GAATTCAAAG
GCGGTTTTTT (2)
GGCTTGAGTT (2)
27.60.0276
P8 GC+1d cultureAAGGTCTCTG
ATTGTAAATT (2)
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGGAGA (3)
GAATTCAAAG
23.90.0239
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGTCTCTG
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGAGAA (2)
CCCAAGGAGA (3)
CCCCAGGAGA
CCTTTAGTTT (3)
GAATTCAAAG
GGCTTGAGTT (2)
37.40.0374
3T3 fibroblastsCCCAAGGAGA (3)
38.60.0386
E15 cortexCCCAAGAGAA (2)
CCCAAGGAGA (3)
GAATTCAAAG
GGCTTGAGTT (2)
19.60.0196
P1 cortexATTGTAAATT (2)
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGGAGA (3)
GAATTCAAAG
GGAAGAGGGA (2)
27.10.0271
HypothalamusATGCTATGGA (3)
CCCAAGGAGA (3)
5.40.0054
E12.5 retinaAAGGTCTCTG
ATTGTAAATT (2)
CAGTACTCTT (2)
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGGAGA (3)
GAATTCAAAG
GGAAGAGGGA (2)
28.30.0283
E14.5 retinaAAGGTCTCTG
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGAGAA (2)
CCCAAGGAGA (3)
GAATTCAAAG
GGAAGAGGGA (2)
16.30.0163
E16.5 retinaATGCTATGGA (3)
ATTGTAAATT (2)
CAGTACTCTT (2)
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGAGAA (2)
CCCAAGGAGA (3)
GAATTCAAAG
GGAAGAGGGA (2)
GTGGAGAATG
360.036
E18.5 retinaAAGGTCTCTG
ATTGTAAATT (2)
CCAGCCACAG (2)
GGAAGAGGGA (2)
12.70.0127
P0.5 retinaATGCTATGGA (3)
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGGAGA (3)
GAATTCAAAG
13.90.0139
P2.5 retinaAAGGTCTCTG
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGAGAA (2)
CCCAAGGAGA (3)
CCCCAGGAGA
CCTTTAGTTT (3)
GAAATTTATA
GAATTCAAAG
GGAAGAGGGA (2)
24.90.0249
P4.5 retinaAAGGTCTCTG
CCCCAGGAGA
CCTTTAGTTT (3)
GAAATTTATA
GAATTCAAAG
GGAAGAGGGA (2)
GGCTTGAGTT (2)
29.80.0298
P6.5 retinaAAGGTCTCTG
ATTGTAAATT (2)
CAGTACTCTT (2)
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGGAGA (3)
CCCCAGGAGA
GAATTCAAAG
GCGGTTTTTT (2)
GGAAGAGGGA (2)
30.10.0301
P10.5 crx- retinaAAGGTCTCTG
ATTGTAAATT (2)
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGGAGA (3)
CCCCAGGAGA
CCTTTAGTTT (3)
GAATTCAAAG
31.70.0317
P10.5 crx+ retinaAAGGTCTCTG
CCCAAGGAGA (3)
GGAAGAGGGA (2)
11.50.0115
Adult retinalAAGGTCTCTG
ATGCTATGGA (3)
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGGAGA (3)
CCCCAGGAGA
GAATTCAAAG
GCGGTTTTTT (2)
33.60.0336
ONLAAGGTCTCTG
CCAGCCACAG (2)
CCCAAGGAGA (3)
CCCCAGGAGA
GAATTCAAAG
GTGGAGAATG
34.40.0344