Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.29742	Cd24a	CD24a antigen	10	10 B2 (10 26.0 cM)	12484
Gene Ontology	external side of plasma membrane | membrane
Human Homolog	CD24[CD24 antigen (small cell lung carcinoma cluster 4 antigen)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 13 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 150 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGAAGTTACT ATTCCGAATT (2) CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GGCAGAGCGA GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TGCCAGGCAA TTATGGAATT TTGGCCTTGG 120.6 0.1206 Cb medulloblastoma GCAACCAAAA (2) GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TTATGGAATT 23.1 0.0231 P8 GC+1d culture AGAAGTTACT CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GGCAGAGCGA GTAAAATGCT GTGCCAGGCA (2) GTGGTTGAAA TCTGTTTGAA (2) TGCCAGGCAA TTATGGAAAT TTATGGAATT TTGGCCTTGG 116.2 0.1162 P8 GC+SHH+1d culture AGAAGTTACT CGAACAAAAG GAATTTGGCA (2) GCAACCAAAA (2) GGCAGAGCGA GTAAAATGCT GTCACACACT GTGGTTGAAA TCTGTTTGAA (2) TGCCAGGCAA TGTTGGATTG (3) TTATGGAATT TTGGCCTTGG 114.9 0.1149 3T3 fibroblasts GTAAAATGCT TTATGGAATT TTGGCCTTGG 28 0.028 E15 cortex CGAACAAAAG GGCAGAGCGA GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TGCCAGGCAA TTATGGAATT 103.8 0.1038 P1 cortex AGAAGTTACT CGAACAAAAG GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TGCCAGGCAA TTATGGAATT TTGGCCTTGG 145.3 0.1453 Hypothalamus GCAACCAAAA (2) GGGGGTTGGG (2) GTGGTTGAAA TCTGTTTGAA (2) TTATGGAATG TTATGGAATT TTGGCCTTGG 39.7 0.0397 E12.5 retina AGAAGTTACT CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TGCCAGGCAA TGTTGGATTG (3) TTATGGAATT TTGGCCTTGG 94.1 0.0941 E14.5 retina AGAAGTTACT CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GTCACACACT GTGCCAGGCA (2) GTGGTTGAAA TCTGTTTGAA (2) TGCCAGGCAA TTATGGAATT 147.5 0.1475 E16.5 retina AGAAGTTACT CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TCTGTTTGAA (2) TGCCAGGCAA TTATGGAAAT TTATGGAATT TTGGCCTTGG 123 0.123 E18.5 retina AGAAGTTACT GCAACCAAAA (2) GTAAAATGCT GTCACACACT GTGGTTGAAA TGCCAGGCAA TTATGGAATT 147.2 0.1472 P0.5 retina AGAAGTTACT CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TGCCAGGCAA TTATGGAATT 68.9 0.0689 P2.5 retina AGAAGTTACT CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GTGGTTGAAA TGCCAGGCAA TTATGGAAAT TTATGGAATT TTGGCCTTGG 74.1 0.0741 P4.5 retina ATTCCGAATT (2) CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GTGGTTGAAA TCTGTTTGAA (2) TGCCAGGCAA TGTTGGATTG (3) TTATGGAAAT TTATGGAATG TTATGGAATT TTGGCCTTGG 97.3 0.0973 P6.5 retina ATTCCGAATT (2) CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GTGGTTGAAA TTATGGAATT 35.1 0.0351 P10.5 crx- retina CGAACAAAAG GCAACCAAAA (2) GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TGCCAGGCAA TTATGGAAAT TTATGGAATT 31.7 0.0317 P10.5 crx+ retina CGAACAAAAG GTAAAATGCT GTGGTTGAAA TTATGGAATT 21.1 0.0211 Adult retinal GAATTTGGCA (2) GCAACCAAAA (2) GTCACACACT GTGCCAGGCA (2) GTGGTTGAAA TCTGTTTGAA (2) TTATGGAATT 18.7 0.0187 ONL ATTCCGAATT (2) GCAACCAAAA (2) GGGGGTTGGG (2) GTAAAATGCT 22.9 0.0229