Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.29760	Psmd13	proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 13	7		23997
Gene Ontology	cytosol | endopeptidase activity | meiosis I | proteasome regulatory particle (sensu Eukarya)
Human Homolog	PSMD13[proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 13]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 113 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT ATCTTGCTGC (3) GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) TTGAATAAAG (6) 39.1 0.0391 Cb medulloblastoma AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT CCCTGTGCTG GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GCTCTATACA 53.1 0.0531 P8 GC+1d culture AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT CCCTGTGCTG GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GCTCTATACA 45.5 0.0455 P8 GC+SHH+1d culture AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT ATCTTGCTGC (3) GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GCTCTATACA 53.8 0.0538 3T3 fibroblasts AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) 80.5 0.0805 E15 cortex AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) 64.2 0.0642 P1 cortex AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) 18 0.018 Hypothalamus AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GAGATGGTCT (2) GCTCTATACA 43.3 0.0433 E12.5 retina AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT ATCTTGCTGC (3) GAGATCCTGG (2) GCTCTATACA TTGAATAAAG (6) 30.1 0.0301 E14.5 retina AAGATGCTGG (3) AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT ATCTTGCTGC (3) GAGATGCTGG (3) GCTCTATACA 38.3 0.0383 E16.5 retina AAGGATGTGC (2) ACGTGGGTGC AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GCTCTATACA 48.8 0.0488 E18.5 retina AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GCTCTATACA TTGAATAAAG (6) 34.6 0.0346 P0.5 retina AAGATGCTGG (3) AAGGATGTGC (2) ACGTGGGTGC AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GCTCTATACA 51.1 0.0511 P2.5 retina AAGGATGTGC (2) ACGTGGGTGC AGACCCTGCT CCCTGTGCTG GAGATGTTGG (2) GCTCTATACA 33.6 0.0336 P4.5 retina AAGATGCTGG (3) AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GCTCTATACA 33.7 0.0337 P6.5 retina AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GCTCTATACA 31.7 0.0317 P10.5 crx- retina AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT CCCTGTGCTG GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GAGATGTTGG (2) GCTCTATACA 96.7 0.0967 P10.5 crx+ retina AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT CCCTGTGCTG GAGATCCTGG (2) GAGATGGTCT (2) GCTCTATACA 46.1 0.0461 Adult retinal AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT CCCTGTGCTG GAGATCCTGG (2) GAGATGCTGG (3) GAGATGTTGG (2) 48.3 0.0483 ONL AAGGATGTGC (2) AGACCCTGCT GAGATGCTGG (3) GAGATGGTCT (2) GCTCTATACA 22.9 0.0229